针对您提出的“法院拍卖的车有违章怎么处理”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、明确责任主体
在处理法院拍卖车辆违章问题时，首先要明确的是责任主体。根据相关法律规定，车辆所有权转移以交付为标志。因此，在车辆交付前产生的违章，原则上应由原车主（即被执行人）负责。然而，在实际操作中，由于原车主可能下落不明或无力承担，买受人需要做好自行处理的准备。
二、违章扣分的处理
处理原则：
- 买受人应充分了解并预见到购买司法拍卖车辆可能存在的违章扣分情况。
- 在实际操作中，由于原车主往往无法联系或无力处理，违章扣分通常由买受人自行解决。
处理建议：
- 购买后，买受人应及时前往当地交警部门，凭借法院的拍卖成交裁定书、协助执行通知书等相关法律文书，申请处理违章扣分。
- 这样可以避免因违章扣分未处理而影响车辆的正常使用，如年检、过户等。
三、违章罚款的处理
处理原则：
- 对于司法拍卖车辆的罚款，一般由法院从成交款中承担。这是因为罚款是针对车辆违法行为的处罚，而该违法行为发生在拍卖前，因此应由原所有人承担。
- 但由于原所有人可能无法联系或无力承担，法院会代为处理并从成交款中扣除。
注意事项：
- 买受人在购买时无需担心因车辆之前的违法行为而产生的罚款问题。
- 但应确保成交款中包含足够金额以覆盖可能的罚款，以免因罚款未支付而导致车辆被扣留或其他问题。
四、与法院的沟通协商
及时联系：
- 发现违章后，买受人应及时与负责该拍卖的法院执行部门取得联系。
- 向工作人员说明情况，并提供车辆违章的具体信息，如违章时间、地点、违章内容等。
遵循指导：
- 按照法院的指导进行后续操作，如提供必要的法律文书、配合完成相关手续等。
- 如果法院承诺协助处理违章，买受人应积极配合，以确保问题得到妥善解决。
五、法律依据
- 《中华人民共和国拍卖法》：委托人在委托拍卖时应提供拍卖标的的所有权证明或依法可以处分的证明。如车辆在拍卖前存在违章且由委托人原因导致，委托人应承担相应责任。
- 《中华人民共和国道路交通安全法》：机动车驾驶人违反道路交通安全法律、法规的，处警告或者罚款等处罚。但对于拍卖车辆而言，罚款部分通常由法院处理。
六、结论与建议
综上所述，处理法院拍卖车辆违章问题时，买受人应首先明确责任主体，并根据拍卖公告和相关法律规定进行相应处理。对于违章扣分，买受人需自行解决；对于违章罚款，则由法院从成交款中承担。在购买前，买受人应充分了解车辆情况，包括是否存在违章、违章的具体情况等。在购买后，买受人应及时与法院及交警部门沟通协商，以确保问题得到妥善解决。如遇不合理要求或难以解决的问题，建议咨询专业律师以维护自己的合法权益。