拥有土地使用合同并不直接决定建筑物是否属于违章建筑，建筑物的合法性需综合考虑多个因素。以下是对这一问题的详细分析：

违章建筑的定义与判定

违章建筑，通常指的是未取得或未按照建设工程规划许可证进行建设的建筑物。这包括但不限于以下几种情形：

1. 未申请或未获批准即擅自建设：在未获得相关规划部门批准的情况下，擅自进行建筑物的建设。
2. 擅自改变已批准的建设工程规划：在建设过程中，未经批准擅自改变原定的建设工程规划。
3. 改变建筑物的原定使用性质：将建筑物用于非原定的用途，如将住宅改为商业用途等。
4. 临时建筑超期未拆转为永久性建筑：临时建筑在超过规定的使用期限后，未进行拆除并转为永久性建筑。

土地使用合同与建筑物合法性的关系

1. 土地使用的合法性：土地使用合同是证明当事人对特定土地拥有合法使用权的重要文件。然而，它仅赋予了使用和开发土地的权利，并不直接等同于建设许可。也就是说，即使拥有土地使用合同，也不能随意在土地上进行建设。
2. 规划与审批的重要性：在土地上建设建筑物时，除了拥有土地使用合同外，还必须按照法定程序办理建设工程规划许可证、施工许可证等相关审批手续。这些手续是确保建筑物符合城市规划、建筑设计规范和安全标准的关键。如果未获得这些审批手续，即使拥有土地使用合同，建筑物也可能被认定为违章建筑。
3. 合同内容与规划要求的匹配：在审查土地使用合同时，需要仔细查看合同中是否明确规定了可以在该土地上建造建筑物，并且这些建筑物是否符合相关的规划、用途等要求。如果合同内容不明确或与当地法律法规相冲突，应以法律法规为准。
4. 实际建设情况的考量：在建设过程中，必须严格按照已批准的规划、设计和施工要求进行。任何偏离这些要求的行为，如超面积建设、改变建筑用途等，都可能导致建筑物被认定为违章建筑。

法律建议

1. 全面了解法律法规：在进行建筑活动前，务必全面了解并遵守当地的法律法规和规章制度，确保建筑行为的合法合规性。
2. 及时咨询专业人士：如果对土地使用合同的内容或相关法律法规存在疑问，应及时咨询专业的律师或相关政府部门的工作人员，以避免不必要的法律风险。
3. 对已存在建筑物的评估：对于已经存在的建筑物，如果担心其可能属于违章建筑，应尽快咨询专业人士进行评估，并根据评估结果采取相应的法律措施。

举例说明：假设某人拥有一块土地的使用合同，并计划在该土地上建设一栋住宅。然而，在未获得建设工程规划许可证和施工许可证的情况下，擅自进行了建设。这种情况下，即使拥有土地使用合同，该建筑物也可能被认定为违章建筑，并面临被限期拆除、罚款等法律后果。

综上所述，判断建筑物是否属于违章建筑是一个综合考量的过程。因此，在进行建筑活动时，务必谨慎行事，确保所有手续齐全且符合法律法规的要求。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。