针对您提出的“虚开5万发票怎么处理”的问题，我会从行政和刑事两个方面为您详细解答。

一、行政处理

根据《中华人民共和国发票管理办法》第三十七条的规定，违反规定虚开发票的，税务机关会采取以下措施：

1. 没收违法所得：对于虚开发票的行为，税务机关首先会没收因虚开发票而获得的违法所得。

2. 罚款：

   • 如果虚开金额在1万元以下，可以并处5万元以下的罚款。
   • 如果虚开金额超过1万元，则并处5万元以上50万元以下的罚款。

在您提到的案例中，虚开金额为5万元，已经超过了1万元的界限，因此税务机关会并处5万元以上50万元以下的罚款。

二、刑事处理

刑事处理方面，主要取决于虚开的发票类型以及虚开税款数额：

1. 虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票：

   • 如果虚开税款数额超过5万元，将构成虚开增值税专用发票罪。
   • 根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金。

2. 虚开普通发票：

   • 虚开普通发票5万元，虽然通常未达到直接构成犯罪的标准（如虚开普通发票罪一般要求虚开金额累计在较大数额，如50万元以上，或存在其他严重情节），但已经达到了“情节严重”的标准。
   • 根据《中华人民共和国发票管理办法》及相关司法解释，虚开普通发票情节严重的，税务机关会进行行政处罚，包括没收违法所得和罚款。
   • 如果虚开普通发票的行为同时符合其他刑事犯罪的构成要件（如诈骗、逃税等），且达到刑事立案标准，公安机关仍可能立案侦查，追究刑事责任。不过，就虚开普通发票本身而言，5万元通常不直接构成虚开发票罪。

三、综合建议

1. 立即停止虚开发票行为：避免进一步违法和扩大损失。

2. 主动配合税务机关调查：如实说明情况，提供相关证据，争取从轻处理。

3. 咨询专业律师：了解自身法律权益和义务，制定合适的应对策略。

4. 加强内部管理：建立健全的财务管理制度，确保发票开具的真实性和合法性。

总之，虚开5万发票将面临严重的行政和可能的刑事后果。建议您立即采取措施，纠正违法行为，并咨询专业律师以获取更具体的法律建议。