针对您提出的问题，即父亲的亲子鉴定有一项不符合，而母亲的亲子鉴定和此项无关，我们首先需要明确的是，亲子鉴定结果的不符合可能涉及多种情况，以下是从不同角度进行的分析和建议：
亲子鉴定结果不符合的可能原因：
- 技术误差：亲子鉴定虽然具有高度的准确性，但仍可能受到技术、操作或样本质量等因素的影响，导致结果出现偏差。这种情况下，建议重新进行亲子鉴定，以确保结果的准确性。
- 非生物学父亲：如果父亲的亲子鉴定结果确实不符合，且排除了技术误差的可能性，那么可能存在孩子并非该父亲生物学子女的情况。这可能是由于婚姻中的不忠行为或其他原因导致的。
- 样本混淆或污染：在亲子鉴定过程中，如果样本被混淆或污染，也可能导致结果不符合。这种情况下，需要重新采集样本并进行鉴定。
针对不同原因的处理建议：
- 若为技术误差：建议选择具有更高资质和经验的鉴定机构重新进行亲子鉴定。同时，确保在鉴定过程中遵循严格的样本采集、保存和运输流程，以减少误差的可能性。
- 若为非生物学父亲：这种情况下，家庭成员之间可能需要面对和解决一些复杂的情感和法律问题。从法律角度来看，如果父亲并非孩子的生物学父亲，但希望继续承担抚养责任，可以通过法律途径确认抚养关系，并保障孩子的合法权益。反之，如果父亲不希望承担抚养责任，也需要通过法律程序来明确双方的权利和义务。
- 若为样本混淆或污染：应立即联系鉴定机构，说明情况并要求重新进行鉴定。同时，确保在重新鉴定过程中严格遵守样本采集和保存的规定，以避免类似问题的再次发生。
法律后果与权益保障：
- 无论亲子鉴定结果如何，都应尊重并保护孩子的合法权益。如果亲子鉴定结果导致家庭关系发生变化，应依法处理相关事宜，如抚养权、继承权等。
- 在处理此类问题时，建议寻求专业律师的帮助，以确保法律程序的合法性和有效性。律师可以提供法律咨询、代理诉讼等服务，帮助您更好地维护自己的权益。
针对您当前的情况，我建议您首先与鉴定机构沟通，了解结果不符合的具体原因，并根据原因采取相应的处理措施。如果涉及法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，提供专业的法律建议和帮助。