林地流转公司本身的合法性取决于其是否依法设立并遵循相关法律法规进行运营，而林地流转行为的合法性则取决于是否严格遵守了相关法律法规和政策规定的条件及程序。以下是对这一问题的详细分析：
一、林地流转公司的合法性
依法设立：
- 林地流转公司若依法在工商行政管理部门登记注册，取得合法的营业执照，并明确其经营范围包含林地流转相关业务，则其设立是合法的。
合规运营：
- 林地流转公司在运营过程中，需严格遵守国家关于林地流转的法律法规，如《中华人民共和国农村土地承包法》、《中华人民共和国森林法》等，确保流转行为的合法性和合规性。
二、林地流转行为的合法性
法律依据：
- 根据《中华人民共和国农村土地承包法》第三十二条，通过家庭承包取得的土地承包经营权可以依法采取转包、出租、互换、转让或其他方式流转。
- 根据《中华人民共和国森林法》第十五条，林地和林地上的森林、林木的所有权、使用权可依法进行流转，并受到法律保护。
合法流转的条件与程序：
- 主体合法性：流转双方必须是依法享有林地权益的权利人，如家庭承包户、村集体经济组织或其他合法权利人。
- 自愿、平等、有偿原则：流转需基于双方自愿，遵循平等和有偿的原则进行，不得强迫或阻碍流转。
- 书面合同：流转行为必须通过签订书面合同来明确双方的权利和义务，包括流转的具体范围、期限、价格等关键条款。
- 流转期限：流转的期限不得超过原承包期的剩余时间，确保流转行为的长期性和稳定性。
- 登记手续：完成流转后，必须及时向县级以上地方人民政府林业主管部门办理林权变更登记，以确保流转的合法性得到官方认可。
特定限制：
- 某些特定的林地，如位于自然保护区、风景名胜区内的，或存在产权争议、被抵押等情况的林地，是不可流转的。尝试流转这些林地将构成违法行为。
三、违法流转的情形
若林地流转过程中存在以下情况，则将被视为违法：
- 未经权利人同意：任何未经林地承包经营权人或所有权人同意的擅自流转行为，均侵犯了权利人的合法权益，属于违法行为。
- 改变林地用途：流转后的林地若被擅自改为非林地用途，如建设用地，将违反《中华人民共和国森林法》的相关规定，构成违法。
- 流转程序不合法：未按规定签订书面合同、未经法定审批程序等，均属于流转程序不合法的情况，也将导致流转行为的违法性。
四、建议与风险提示
- 了解法律法规：在进行林地流转前，务必了解清楚相关法律法规和政策规定，确保流转行为的合法合规。
- 谨慎选择流转对象：选择信誉良好、依法设立的林地流转公司或个人作为流转对象，降低法律风险。
- 及时办理登记手续：完成流转后，务必及时向相关部门办理林权变更登记，确保流转的合法性得到官方认可。
- 咨询专业律师：如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我将为你提供专业的法律意见和帮助。