行政机关起诉股东的时效问题，需根据具体情形和所依据的法律规范来确定，一般而言，涉及的是诉讼时效或追诉时效的相关规定。以下从不同角度进行分析：
一、诉讼时效的一般规定
民事诉讼时效：
- 在民事法律关系中，通常适用的是《中华人民共和国民法典》中关于诉讼时效的规定。一般诉讼时效期间为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
- 如果行政机关作为民事主体（如在其财产权益受到股东侵害时），其起诉股东的时效可能受此规定约束。但需注意，行政机关作为民事主体起诉股东的情况相对较少，更多是在其行使行政职权过程中涉及的法律关系。
行政诉讼时效：
- 行政诉讼时效主要针对的是公民、法人或其他组织认为行政机关的行政行为侵犯其合法权益而提起的诉讼。其时效规定与民事诉讼时效有所不同，且通常不直接涉及行政机关起诉股东的情形。
- 但若行政机关在行使职权过程中，发现股东有违法行为（如逃税、欺诈等），并欲通过法律途径追究其责任，此时可能涉及的是行政处罚的追诉时效或刑事追诉时效，而非直接的诉讼时效。
二、追诉时效的特别规定
行政处罚追诉时效：
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》的规定，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚。法律另有规定的除外。这一规定主要针对的是行政机关对违法行为的处罚时效。
- 如果行政机关欲对股东的违法行为进行行政处罚，需在二年内发现并处理，否则将失去处罚权。但这并不直接等同于行政机关“起诉”股东的时效，因为起诉更多涉及的是司法程序。
刑事追诉时效：
- 如果股东的违法行为构成犯罪，行政机关（或更准确地说，是检察机关）将依据《中华人民共和国刑法》关于追诉时效的规定来追究其刑事责任。
- 刑事追诉时效根据犯罪的法定最高刑来确定，从五年到二十年不等，甚至在某些情况下可能不受追诉时效的限制（如法定最高刑为无期徒刑、死刑的，经过二十年认为还必须追诉的，须报请最高人民检察院核准）。
三、针对股东特定行为的时效
- 如果股东的行为涉及特定法律规范（如证券法、公司法中的特定条款），则可能适用这些法律规范中规定的时效。例如，证券法中可能规定了对内幕交易、操纵市场等违法行为的追诉时效。
- 此外，如果股东的行为导致公司或其他股东遭受损失，公司或其他股东可能依据公司法或相关民事法律提起诉讼，此时将适用民事诉讼时效的规定。
法律建议
- 明确法律关系：首先需明确行政机关与股东之间的法律关系，以及行政机关欲通过法律途径追究股东责任的具体依据。
- 及时行使权利：无论适用何种时效规定，行政机关都应及时行使权利，避免因时效过期而丧失法律救济的机会。
- 咨询专业律师：由于时效问题涉及复杂的法律规范和司法实践，建议行政机关在具体操作前咨询专业律师，以确保法律行为的合法性和有效性。
如有具体法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。我将根据您的具体情况，提供专业、全面的法律服务。