扣质保金（通常指在工程完成后，因特定原因需从质保金中扣除部分或全部金额）的手续，主要依据的是工程承包合同中的相关约定以及相关的管理办法。以下是一般情况下扣质保金所需遵循的手续和流程，结合您提供的参考信息，我将尽量给出详细且清晰的解答：
一、前提条件与合同约定
合同明确：首先，发包人与承包人应在建设工程承包合同中明确质保金的预留、返还、扣除等条款，包括但不限于质保金的预留比例、期限、扣除条件、返还方式等。
缺陷责任期：根据《建设工程质量保证金管理办法》，缺陷责任期一般为1年，最长不超过2年，由发、承包双方在合同中约定。在此期间内，若工程出现缺陷，且经确认是由承包人原因造成的，发包人有权从质保金中扣除相应维修费用。
二、扣质保金的手续
缺陷确认：
- 当工程在缺陷责任期内出现缺陷时，发包人应首先组织相关人员进行缺陷确认，明确缺陷的性质、原因及维修所需费用。
- 若缺陷是由承包人原因造成的，发包人应准备相关证据材料，如检测报告、照片等。
通知承包人：
- 发包人应及时将缺陷情况及拟扣除的质保金金额通知承包人，并要求承包人在规定时间内进行维修或提出异议。
承包人响应：
- 承包人应在收到通知后，及时对缺陷进行维修，并承担维修费用。若承包人认为缺陷非其责任，或认为扣除的质保金金额不合理，可提出异议，并与发包人进行协商。
扣除手续：
- 若承包人未在规定时间内进行维修，或维修后未达到合同约定的标准，发包人可按照合同约定从质保金中扣除相应费用。
- 扣除时，发包人应出具正式的扣除通知，明确扣除的金额、原因及依据，并要求承包人签字确认。若承包人拒绝签字，发包人可保留相关证据，如通知记录、缺陷确认材料等。
财务处理：
- 发包人财务部门应根据扣除通知，从质保金账户中扣除相应金额，并进行相应的财务处理。
- 扣除后，发包人应将扣除情况通知承包人，并保留好相关财务凭证。
三、特殊情况处理
- 争议解决：若发包人与承包人对质保金的扣除存在争议，应按照合同约定的争议解决程序进行处理，如协商、调解、仲裁或诉讼等。
- 第三方托管：对于社会投资项目，若采用预留保证金方式，发、承包双方可以约定将保证金交由第三方金融机构托管。在此情况下，扣质保金的手续可能涉及与第三方金融机构的沟通与协调。
四、注意事项
- 合规性：发包人在扣质保金时，应确保所有手续均符合合同约定及相关法律法规的规定，避免因违规操作而引发法律纠纷。
- 透明度：扣质保金的过程应保持透明，确保承包人充分了解扣除的原因、金额及依据，以维护双方的合法权益。
综上所述，扣质保金的手续主要涉及缺陷确认、通知承包人、承包人响应、扣除手续及财务处理等环节。在实际操作中，发包人应严格按照合同约定及相关法律法规的规定执行，确保扣质保金的过程合法、合规、透明。