司法审计是司法机关在办理案件过程中，为查明经济案件事实，对涉及的财务资料等进行的审查与鉴定活动，其法律规定与程序严谨而系统，主要涵盖以下几个阶段：
一、启动阶段
司法机关决定：
出具相关文书：司法机关决定审计后，应出具《审计委托书》等正式委托文书，明确审计目的、范围、内容、时间要求，并加盖公章。
确认审计需求：确保存在会计事项的违法犯罪行为，或当事人已处于诉讼阶段并准备相关资料申请司法审计，以保障审计的必要性和合理性。
二、选择审计机构阶段
确定备选机构：司法机关从专门鉴定机构名册中选取符合条件的审计机构，这些机构需具备相应资质、专业人员、良好信誉和执业记录。
选定具体机构：可通过随机抽取、协商选定等方式确定审计机构。协商选定时需经司法机关认可。
预付审计费用：当事人需自愿预付审计费用，作为启动司法审计的重要前提。
三、审计实施阶段
审计机构接受委托：审计机构与司法机关签订委托审计协议，明确双方权利义务，并组建专业审计团队。
审计资料的提供与接收：司法机关提供全部相关资料，包括财务会计凭证、账簿、报表、合同等。审计机构进行详细登记和交接，确保资料完整安全。
指派审计人员：审计机构指派具有资格的审计人员负责审计工作，确保审计的专业性、准确性和公正性。
实施审计工作：审计人员按照审计准则和相关规定进行审查、核对、分析等工作。可向有关单位和个人调查询问，收集证据，但需遵守法定程序。
四、审计报告阶段
出具审计报告：审计机构完成审计后，及时出具审计报告，包括基本情况、依据、方法、结果及结论等。报告需加盖公章并由审计人员签名。
报告送达与告知：司法机关将审计报告送达当事人，并告知其有申请重新或补充审计的权利。当事人有异议时，需在规定期限内提出书面申请并说明理由。
作为证据使用：审计报告作为重要证据，可供司法机关在诉讼中使用，也为当事人提供了改进和规范会计行为的依据。
五、重新审计或补充审计阶段
申请与审查：当事人申请重新或补充审计时，司法机关对申请进行审查。若当事人能提供证据证明审计报告存在问题，如程序违法、依据错误、审计人员不具备资质等，司法机关可决定进行重新或补充审计。
重新或补充审计的实施：重新或补充审计的程序与初次审计基本相同，但审计机构需针对异议进行重点审查和核实。
六、法律责任与监督
承担法律责任：审计人员对其作出的审计意见负责，并依法承担相应的法律责任，确保审计活动的严肃性和权威性。
接受监督：司法审计活动依法接受相关部门监督，确保其合法、公正、有效。监督包括对审计程序、方法、结论等的审查和复核。
在实际操作中，司法审计的法律规定与程序可能因地区和具体案件而有所差异。因此，在进行司法审计时，建议根据当地法律法规和具体情况进行调整和完善，以确保审计的准确性和公正性。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。