针对您骑摩托车被逆行的自行车撞了这一情况，赔偿问题的处理需要综合考虑多个方面，以下是我为您提供的详细解答：
一、责任划分
首先，根据交警部门出具的事故责任认定书来确定双方的责任比例。在您描述的情况中，对方骑自行车逆行，通常会被认定为事故的主要责任方，而您作为摩托车驾驶者，如果未存在其他违规行为（如超速、酒驾等），则可能承担次要责任。责任比例的具体划分将依据现场勘查、调查取证的结果以及相关法律法规来确定。
二、赔偿范围与项目
赔偿范围主要包括人身损害赔偿和财产损害赔偿两部分：
人身损害赔偿：
- 医疗费：包括对方的住院费用、手术费用、药品费用等，以及您自己的医疗费用（如果有责任）。
- 误工费：因受伤住院治疗导致的工作收入损失，根据误工时间和收入状况计算。
- 护理费：根据护理人员收入状况和护理人数、期限确定。
- 交通费：因治疗产生的交通成本，如来回医院的打车费用等。
- 营养费：治疗期间的营养补充费用。
- 住院伙食补助费：参照当地国家机关一般工作人员的出差伙食补助标准确定。
- 精神损失费：因事故导致的精神压力和心理损失费用（此项费用通常需要根据具体情况和法院判决来确定）。
财产损害赔偿：
三、赔偿程序与方式
交强险赔偿：
- 如果您已经为摩托车购买了交强险，那么优先由交强险在责任限额范围内进行赔偿。交强险的赔偿限额包括死亡伤残赔偿限额、医疗费用赔偿限额和财产损失赔偿限额。
- 在您的情况下，如果对方承担主要责任，您承担次要责任，那么超出交强险赔偿限额的部分，您可能需要按照责任比例（如30%或40%）来承担赔偿责任。
协商与调解：
- 在明确责任比例后，您可以与对方进行沟通，了解对方的诉求和需要赔付的费用明细。
- 双方可以尝试通过协商来达成一个公平合理的赔偿协议。如果协商不成，可以邀请交警部门或者人民调解委员会参与调解。
诉讼：
- 如果协商和调解均无法达成一致，双方可以选择向人民法院提起诉讼，由法院根据事实和法律规定来判决赔偿金额。
四、注意事项
保留证据：
- 妥善保留与事故相关的所有证据，如事故责任认定书、医疗费用发票、诊断证明、误工证明、财产损失清单及评估报告等。这些证据将在后续的协商、调解或诉讼中起到关键作用。
法律咨询：
- 在处理赔偿事宜时，建议咨询专业律师以获取更准确的法律建议和帮助。律师可以根据您的具体情况和当地法律法规来为您提供个性化的法律指导。
综上所述，骑摩托车被逆行的自行车撞了后的赔偿问题涉及责任划分、赔偿范围与项目、赔偿程序与方式等多个方面。在实际操作中，请务必遵循相关法律法规的规定，确保赔偿事宜的公正、合理和合法。同时，积极配合相关部门的调查和处理工作，并妥善保留证据以便后续协商或诉讼使用。