关于实习协议与转正后三方协议签订主体的问题，结论是转正后的三方协议签订主体通常应与最终建立劳动关系的主体一致，但具体还需根据实际情况和校招流程来确定。以下是对此问题的详细分析：

一、实习协议与劳动关系的建立

1. 实习协议的性质：实习协议通常是实习生与实习单位（在此情况下为外包公司）之间就实习期间的工作内容、待遇、期限等事项达成的协议。它并不直接等同于劳动合同，但为双方建立了一定的权利义务关系。

2. 劳动关系的建立：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动关系自用工之日起建立。这意味着，当实习生通过校招转正，并与目标公司建立正式的劳动关系时，应与该目标公司签订劳动合同（或在此情况下的三方协议，若涉及学校、学生和用人单位三方）。

二、转正后三方协议的签订主体

1. 通常情况：在大多数情况下，如果实习生通过校招转正，并且目标公司愿意直接与其建立劳动关系，那么转正后的三方协议（或劳动合同）应由实习生、目标公司和学校（如涉及）共同签订。这是因为此时实习生已经或即将成为目标公司的正式员工，与目标公司建立直接的劳动关系。

2. 特殊情况：然而，也存在一些特殊情况。例如，如果校招流程中明确规定了实习协议与转正后的劳动合同（或三方协议）签订主体可以不同，或者目标公司与外包公司之间有特殊的合作安排，那么转正后的三方协议签订主体可能会有所不同。但这种情况相对较少，且通常会在校招公告或相关协议中明确说明。

三、建议与注意事项

1. 仔细阅读校招公告和协议：在参与校招前，务必仔细阅读校招公告和相关协议，了解实习协议与转正后劳动合同（或三方协议）的签订主体、流程等关键信息。

2. 与目标公司和外包公司沟通：如果有任何疑问或不确定的地方，建议及时与目标公司和外包公司进行沟通，以获取准确的信息和指导。

3. 保护自身权益：在签订任何协议前，都要确保自己的权益得到充分保护。如果发现协议中有任何不公平或不合法的条款，应及时提出并寻求法律帮助。

举例说明：假设你是一名在校大学生，通过校招进入了一家目标公司实习，但实习协议是与外包公司签订的。在实习期间，你表现优秀，通过了目标公司的考核并获得了转正机会。此时，你应与目标公司协商签订转正后的劳动合同（或三方协议），而不是继续与外包公司保持关系。因为此时你已经或即将成为目标公司的正式员工，与目标公司建立直接的劳动关系。

综上所述，转正后的三方协议签订主体通常应与最终建立劳动关系的主体一致。但具体还需根据校招流程、目标公司与外包公司之间的合作安排以及相关法律法规来确定。如果有任何疑问或不确定的地方，建议及时咨询并获取专业法律意见。