若骑电动自行车被电子眼拍到，但实际骑车人并非本人，交警会按照以下流程处理：
接收通知：
- 交警部门会通过邮寄、电子邮件或短信等方式，将交通违法行为的通知发送给车辆登记所有人（即您）。通知中会详细列明违法时间、地点、行为等信息。
确认违法信息：
- 收到通知后，您应仔细核对通知中的违法信息。若确认并非本人驾驶，则无需承担此次违法行为的责任。但此时，您不能简单地忽略通知，因为交警部门可能已根据电子眼抓拍记录，将违法行为记录在了您的交通违法记录中。
提出申诉：
- 申诉途径：您应携带有效身份证件，到违法发生地的交通违法审理“窗口”当场提出申辩，说明实际情况并提供相关证据（如行车记录仪视频、目击者证言等），以证明并非本人驾驶。部分地区也支持通过电话、网络平台等方式进行远程申诉，具体可咨询当地交警部门。
- 申诉内容：在申诉时，您应明确指出电子眼抓拍记录中的驾驶人并非您本人，并请求交警部门撤销此次违法行为记录。
交警部门处理：
- 交警部门在收到您的申诉后，会进行调查核实。若确认违法行为并非您本人所为，交警部门会撤销此次违法行为记录，并通知您申诉结果。
法律建议：
- 及时申诉：一旦收到交通违法行为的通知，且确认并非本人驾驶，应尽快提出申诉，以免影响个人交通违法记录。
- 保留证据：在申诉过程中，提供充分的证据以证明并非本人驾驶，这将有助于交警部门更快地作出正确判断。
- 关注处理结果：申诉后，应关注交警部门的处理结果，确保违法行为记录已被正确撤销。
可能的法律后果：
- 若未及时申诉：若您未及时提出申诉，且交警部门已根据电子眼抓拍记录将违法行为记录在了您的交通违法记录中，这可能会对您的个人信用和驾驶记录产生不良影响。
- 若申诉成功：若您及时提出申诉，并提供了充分的证据，交警部门会撤销此次违法行为记录，您的个人信用和驾驶记录将不会受到影响。
特殊情况处理：
- 若车辆被借用或盗用：若您的电动自行车被他人借用或盗用，并因此产生了交通违法行为，您应在申诉时说明情况，并提供相关证据（如车辆借用协议、报警记录等）。交警部门在核实情况后，会撤销此次违法行为记录，并可能对实际驾驶人进行追责。
总之，面对此类情况，关键在于及时、有效地提出申诉，并提供充分的证据以证明并非本人驾驶。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。