当破产企业经过三次拍卖均流拍后，接下来的处理方式会涉及多个环节和法律程序，以确保债权人的利益得到最大程度的保护。以下是详细的处理步骤：

一、询问债权人是否接受抵债

首先，法院会询问申请执行人或其他执行债权人是否愿意接受以第三次拍卖的保留价来抵债。如果债权人接受，那么该财产将作价交给债权人以抵偿债务。抵债后，财产的所有权自裁定送达时起即发生转移。

二、发出变卖公告

若申请执行人及其他执行债权人拒绝接受抵债，法院应当在第三次拍卖终结之日起七日内发出变卖公告。这个公告的目的是寻找愿意以第三次拍卖的保留价购买该财产的买受人。

三、变卖程序

自公告之日起六十日内，如果没有买受人愿意以第三次拍卖的保留价买受该财产，且申请执行人、其他执行债权人仍不表示接受该财产抵债，那么法院将解除对该财产的查封、冻结，并将其退还被执行人。但需要注意的是，如果对该财产可以采取其他执行措施（如再次拍卖但调整拍卖条件、寻找特定买家等），则法院可能会采取这些措施。

四、进入以物抵债或强制清算程序

1. 以物抵债：

   • 如果债权人愿意接受以物抵债，法院会根据相关规定和评估结果，确定可以用来抵债的资产。
   • 这些资产可能是厂房、土地、机器设备等固定资产，也可能是存货、应收账款等流动资产。
   • 法院会尽力寻找合适的债权人愿意接受以这些资产抵债，以实现破产企业资产的最大价值变现。

2. 强制清算程序：

   • 如果无法通过以物抵债的方式解决，法院可能会指定清算组对破产企业进行全面清算。
   • 清算组会对企业的资产进行详细清查、评估和处置，包括追收债权、处理剩余资产等工作。
   • 在这个过程中，清算组需要严格按照法定程序进行操作，确保清算工作的公正、公平、合法。

五、法院监督与债权人参与

• 在整个处理过程中，法院会对整个过程进行严格监督，确保债权处理的公正、合法与透明。
• 债权人也可以通过法定途径参与到清算过程中，表达自己的诉求和意见。

六、注意事项

• 破产企业三次流拍后的处理方式是一个较为复杂的过程，需要法院、清算组和债权人等各方的共同协作。
• 在处理过程中，必须严格遵循相关法律规定及执行程序，以保障各方当事人的合法权益。

综上所述，当破产企业经过三次流拍后，会进入一个涉及多个环节和法律程序的处理阶段。这个阶段需要法院、清算组和债权人等各方的紧密合作，以确保破产程序的顺利进行和债权人利益的最大程度保护。