未取得施工许可证进行施工，一般由县（市）以上建设行政主管部门或发证机关进行处罚。具体分析如下：
一、处罚机关
县（市）以上建设行政主管部门：
- 根据《河南建筑市场管理条例》第四十七条第五项，未办理施工许可证擅自开工的，由县（市）以上建设行政主管部门视情节轻重责令限期改正、降低资质等级或吊销资质证书，并可处五千元以上三万元以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。
发证机关：
- 根据《建筑工程施工许可管理办法》第十二条，对于未取得施工许可证或者为规避办理施工许可证将工程项目分解后擅自施工的，由有管辖权的发证机关责令停止施工，限期改正，对建设单位处工程合同价款1%以上2%以下罚款；对施工单位处3万元以下的罚款。
二、处罚措施
责令停止施工：
- 无论是由县（市）以上建设行政主管部门还是发证机关进行处罚，首要措施都是责令停止施工，以防止违规行为继续进行。
限期改正：
- 处罚机关会要求违规单位在规定期限内改正违规行为，如补办施工许可证等。
罚款：
- 对建设单位：根据工程合同价款的比例处以罚款，具体为工程合同价款1%以上2%以下。
- 对施工单位：处以3万元以下的罚款。
其他处罚：
- 根据违规情节的严重程度，处罚机关还可能视情况采取降低资质等级、吊销资质证书等措施。
三、特殊情况
- 如果因发证机关及其工作人员的原因导致建设单位未能及时取得施工许可证而施工，根据《建筑工程施工许可管理办法》第十条，建设单位和施工单位将不会受到上述罚款处罚。但这并不意味着可以随意违规施工，因为一旦被发现，仍可能面临其他形式的处罚，且这种特殊情况较为罕见。
四、法律建议
- 严格遵守法律法规：建设单位和施工单位应严格遵守相关法律法规，按照规定程序申请施工许可证，确保工程项目的合法合规进行。
- 及时咨询专业律师：如果在施工过程中遇到任何法律问题或疑虑，建议及时咨询专业律师，以获取专业的法律意见和帮助。
未取得施工许可证擅自施工是严重的违法行为，将面临严厉的法律处罚。因此，各建设单位和施工单位应高度重视施工许可证的申请与办理工作。如有任何法律问题，可以直接向我咨询。