针对当事人主张多个法律关系且其中一个被告应当为共同原告的情况，处理方式需根据具体法律关系和案件事实进行综合判断，以下是从不同角度的分析和建议：

1. 法律关系梳理与主体确定：

   • 首先，需要明确当事人主张的多个法律关系各自的内容、性质及相互间的关联。例如，可能涉及合同关系、侵权关系等。
   • 接着，分析每个法律关系中的主体，确定哪些主体是必要的当事人。若某一被告在某一法律关系中应作为原告参与诉讼（如因该被告的行为导致原告权益受损，且该被告与原告有直接的利害关系），则需考虑将其列为共同原告。但通常，被告不会直接变为原告，这里的“应当为共同原告”可能指的是原诉讼中的某一被告在另一法律关系中应作为原告身份参与，或者原告诉求中包含了应由该“被告”以原告身份主张的权利。更准确的表述可能是，在梳理法律关系时，发现原诉讼结构中的某一“被告”角色，在另一层法律关系上，其权益也受到了影响，且该影响与原告诉求相关联，理论上若其要主张自身权益，应作为原告，但在当前诉讼中，可能需通过追加当事人、变更诉讼请求等方式调整诉讼结构。

2. 诉讼结构的调整：

   • 追加当事人：若发现某一被告在另一法律关系中应作为原告，但当前诉讼中未将其列为原告，且该法律关系与当前诉讼有关联，可以考虑通过追加当事人的方式，将其纳入诉讼，明确其在诉讼中的地位和权利义务。但需注意，追加当事人需符合法律规定的条件，且不得违反诉讼程序的公正性和效率性。
   • 变更诉讼请求：若原告诉求中未涵盖应由该“被告”以原告身份主张的权利，且该权利与当前诉讼紧密相关，原告可以考虑变更诉讼请求，将相关权利纳入诉求范围。但变更诉讼请求需在法律规定的期限内提出，并需经法院审查同意。
   • 分案处理：若多个法律关系相对独立，且涉及不同的主体和事实，可以考虑将案件分案处理，分别提起诉讼。这样有助于更清晰地梳理法律关系，明确各方当事人的权利义务。

3. 法律后果与风险提示：

   • 诉讼风险：调整诉讼结构可能带来诉讼风险，如追加当事人可能导致诉讼周期延长、诉讼成本增加等。因此，在决定调整诉讼结构前，需充分评估诉讼风险，并制定相应的应对策略。
   • 证据收集：无论选择何种方式调整诉讼结构，都需要充分收集证据，以支持自己的主张。证据是诉讼的关键，缺乏充分证据可能导致诉讼失败。
   • 法律适用：在处理多个法律关系时，需注意不同法律关系可能适用不同的法律规定。因此，在梳理法律关系和确定诉讼结构时，需充分考虑法律适用的问题，确保自己的主张有法律依据。

具体操作建议：

• 在遇到此类复杂情况时，建议当事人及时咨询专业律师，进行详细的法律分析和诉讼策略制定。
• 律师应全面审查案件材料，梳理法律关系，明确各方当事人的地位和权利义务。
• 根据案件具体情况，制定合适的诉讼策略，包括是否追加当事人、是否变更诉讼请求、是否分案处理等。
• 在诉讼过程中，密切关注案件进展，及时调整诉讼策略，以应对可能出现的各种情况。