新三板企业增资扩股时，实控人已发生变化，原实控人签订的对赌协议是否有效，需结合具体情况分析，但通常来说，若协议内容合法且未违反强制性规定，协议本身是有效的。以下从不同角度进行详细分析：
一、对赌协议的法律效力基础
合同自由原则：
- 根据《民法典》的相关规定，合同是民事主体之间设立、变更、终止民事法律关系的协议。只要合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，合同即具有法律效力。
- 对赌协议作为合同的一种，其法律效力同样受合同自由原则的保护。
对赌协议的合法性：
- 对赌协议通常涉及业绩补偿、股权回购等条款，这些条款本身并不违法，只要其不损害公司、股东及债权人的利益，且符合公司章程和相关法律法规的规定。
- 若对赌协议的内容合法，且签订时双方意思表示真实，未受欺诈、胁迫等，则协议具有法律效力。
二、实控人变化对对赌协议的影响
实控人变化的法律性质：
- 实控人变化通常涉及公司股权结构的调整，但并不直接影响已签订的合同的法律效力。
- 除非对赌协议中明确约定了实控人变化作为协议失效或变更的条件，否则实控人的变化本身不会导致对赌协议无效。
新实控人的权利与义务：
- 新实控人接管公司后，应继承并履行公司原有的合同义务，包括对赌协议中的相关义务。
- 若新实控人拒绝履行对赌协议，可能构成违约，需承担相应的法律责任。
三、对赌协议可能无效的情形
违反法律法规的强制性规定：
- 若对赌协议的内容违反了法律、行政法规的强制性规定，如涉及非法集资、操纵市场等违法行为，则协议无效。
损害公司、股东及债权人利益：
- 若对赌协议的条款设计不合理，导致公司、股东或债权人的利益受损，如过高的业绩补偿要求、不合理的股权回购条件等，可能因损害他人利益而被认定为无效。
签订时存在欺诈、胁迫等情形：
- 若对赌协议是在一方受欺诈、胁迫等情形下签订的，受损害方有权请求法院或仲裁机构撤销协议。
四、法律建议
审查对赌协议内容：
- 在签订对赌协议前，应仔细审查协议内容，确保其合法、合规，并符合公司及股东的利益。
明确实控人变化的处理方式：
- 在对赌协议中明确约定实控人变化时的处理方式，如是否继续履行协议、如何调整协议条款等，以避免未来可能出现的纠纷。
及时咨询专业律师：
- 若对新三板企业增资扩股时实控人变化对对赌协议的影响存在疑问，应及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见。
总结来看，新三板企业增资扩股时，实控人已发生变化，原实控人签订的对赌协议在内容合法且未违反强制性规定的情况下，通常是有效的。但需注意实控人变化可能带来的合同履行问题，以及协议中可能存在的无效情形。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。