商贷五年后转公积金贷款，半年后提前还部分款项一般不算违约，但具体情况还需根据您与公积金贷款机构签订的贷款合同来确定。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、贷款合同条款
提前还款条款：
- 公积金贷款合同中通常会包含关于提前还款的条款。这些条款会明确规定借款人是否可以提前还款，以及提前还款的具体条件和限制（如是否需要支付违约金、提前通知期限等）。
- 若合同中明确允许提前还款且未设定违约金或相关限制，则您提前还部分款项不会构成违约。
- 若合同中设定了提前还款的违约金或相关限制，则您需要按照合同约定执行，否则可能构成违约。
合同变更与补充协议：
- 在商贷转公积金贷款的过程中，您可能与贷款机构签订了新的贷款合同或补充协议。这些文件可能对提前还款有新的规定或修改。
- 务必仔细阅读并理解新合同或补充协议中的相关条款，以确保您的提前还款行为符合合同约定。
二、法律法规与政策
相关法律法规：
- 根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，借款人有权在符合合同约定和法律规定的情况下提前还款。
- 但法律法规并未对提前还款的具体条件和限制作出统一规定，而是由贷款合同双方自行约定。
公积金贷款政策：
- 公积金贷款政策可能因地区和时间而异。不同地区的公积金管理中心可能对提前还款有不同的规定和要求。
- 建议您咨询当地公积金管理中心或查阅相关政策文件，以了解具体的提前还款政策和要求。
三、实际操作建议
查阅贷款合同：
- 首先查阅您与公积金贷款机构签订的贷款合同，特别是关于提前还款的条款和条件。
- 若合同中有明确规定，则按照合同约定执行；若合同中未明确规定或规定不明确，则建议与贷款机构协商解决。
与贷款机构沟通：
- 在提前还款前，建议您与公积金贷款机构进行沟通，了解提前还款的具体流程和要求。
- 询问是否需要支付违约金、提前通知期限等事项，以确保您的提前还款行为符合贷款机构的要求。
保留相关证据：
- 在提前还款过程中，建议您保留好相关证据，如还款凭证、与贷款机构的沟通记录等。
- 这些证据可以在发生纠纷时作为证明您提前还款行为合法性的依据。