针对您提出的“公司法人违反公司考勤怎么处理”的问题，这实际上涉及到了公司内部管理规定以及可能的行政处罚两个层面。以下是我为您提供的详细解答：

一、公司内部管理层面

1. 查阅公司考勤管理制度：

   • 首先，需要查阅公司具体的考勤管理制度，了解其中对于迟到、早退、旷工等行为的定义及相应的处罚措施。不同公司的考勤管理制度可能有所不同，因此这一步至关重要。

2. 根据制度进行处罚：

   • 如果公司法人确实违反了考勤制度，如无故迟到、早退或旷工，那么应根据公司制度进行相应的处罚。这可能包括扣减绩效工资、通报批评、取消评先树优资格，甚至在严重情况下予以辞退。

3. 内部处理流程：

   • 公司应建立一套完善的内部处理流程，包括调查取证、告知违法事实、听取陈述申辩、作出处理决定等步骤，以确保处理过程的公正性和合法性。

二、行政处罚层面

1. 劳动保障行政部门介入：

   • 如果公司法人的违反考勤行为同时违反了劳动保障法律、法规或规章，如违法延长劳动者工作时间，那么劳动保障行政部门有权介入调查。

2. 行政处罚措施：

   • 根据《劳动保障监察条例》等相关法律法规，劳动保障行政部门可以给予警告、责令限期改正，并可以按照受侵害的劳动者每人100元以上500元以下的标准计算，处以罚款。

3. 处理流程：

   • 劳动保障行政部门在处理此类案件时，会遵循立案、调查取证、审理、告知、决定、送达和执行等责任事项，确保处理过程的合法性和有效性。

三、综合建议

1. 加强内部管理：

   • 公司应加强对考勤制度的宣传和执行力度，确保所有员工都了解并遵守相关规定。

2. 完善监督机制：

   • 建立有效的监督机制，如设立考勤监督员或利用现代技术手段进行考勤监控，以及时发现并纠正违反考勤制度的行为。

3. 加强法律培训：

   • 定期对公司员工进行法律培训，提高他们的法律意识和合规意识，减少因不了解法律而导致的违法行为。

4. 及时沟通与处理：

   • 一旦发现公司法人或其他员工违反考勤制度，应及时进行沟通和处理，避免问题扩大化或引发更严重的法律后果。

综上所述，对于公司法人违反公司考勤的处理，应首先根据公司内部考勤管理制度进行处罚，并确保处理过程的公正性和合法性。同时，如果违反行为同时违反了劳动保障法律、法规或规章，劳动保障行政部门也有权介入并给予相应的行政处罚。