结论前置：

1. 在职期间可以就年休假补偿问题申请劳动仲裁。
2. 申请劳动仲裁时，需准备充分的证据材料，并遵循法定程序。

一、在职期间能否就年休假补偿问题申请劳动仲裁

可以。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二条的规定，因工作时间、休息休假等发生的争议属于劳动争议范畴，适用该法。年休假作为劳动者休息休假的重要组成部分，若用人单位克扣年休假或未支付相应的工资报酬，即损害了劳动者的合法权益，劳动者依法有权申请劳动仲裁来维护自身权益。

二、申请劳动仲裁的准备材料及流程

准备材料：

1. 仲裁申请书：需详细说明仲裁请求，如要求用人单位支付未休年休假的工资报酬，并阐述事实和理由，具体说明年休假被克扣的情况。同时，载明劳动者的姓名、性别、年龄、职业、工作单位和住所，以及用人单位的名称、住所和法定代表人或主要负责人的姓名、职务。
2. 身份证明：提供本人身份证等有效身份证件的复印件。
3. 劳动关系证明材料：包括劳动合同、工资条、工作证、考勤记录等，以证实劳动者与用人单位之间的劳动关系。
4. 年休假相关证据：如单位关于年休假安排的通知、自己申请年休假的记录（邮件、审批表等）、实际未被批准休假或被不合理剥夺年休假的证据。

流程：

1. 提交申请：将书面仲裁申请书及副本提交至仲裁委员会。
2. 审查受理：仲裁委员会在五日内审查并决定是否受理。
3. 开庭审理：若受理，仲裁庭将进行开庭审理，查明事实。
4. 调解与裁决：仲裁庭将促使双方自愿达成协议；若调解未成，及时作出裁决。

三、可能获得的补偿及计算标准

若仲裁庭认定用人单位存在克扣年休假的情况，通常会裁决用人单位按法律规定支付劳动者未休年休假的工资报酬。具体支付标准如下：

• 若已支付正常工作期间工资，则需另行支付日工资收入的200%作为未休年休假工资报酬。
• 计算公式：未休年休假工资报酬 = 日工资收入 × 200% × 未休年休假天数。其中，日工资收入按照劳动者本人月工资除以月计薪天数（21.75天）进行折算。

四、注意事项

1. 申请期限：申请劳动仲裁的期限通常为一年，从当事人知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。因此，劳动者应及时采取行动，避免超过仲裁时效。
2. 证据保留：劳动者应妥善保留所有与年休假相关的证据，以便在仲裁过程中证明自己的主张。
3. 法律咨询：在申请劳动仲裁前，劳动者可以咨询专业律师，了解自己的权益和申请劳动仲裁的具体流程，以提高胜诉率。

总结与建议： 在职期间，若遇到年休假被克扣或未支付相应工资报酬的情况，劳动者完全有权申请劳动仲裁来维护自身合法权益。在申请劳动仲裁时，需准备充分的证据材料，并遵循法定程序。同时，劳动者也应注意仲裁时效和证据保留问题，以确保自己的权益得到有效维护。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。