针对您提出的小店股东退出怎么清算的问题，这确实是一个涉及公司法、合同法以及公司章程等多方面规定的复杂问题。下面，我将为您详细梳理小店股东退出的清算方式及步骤，帮助您更好地理解和操作。
一、股东退出清算的常见方式
股权转让：
- 内部转让：股东可以将自己的股权转让给其他股东。这种方式相对简单，只需双方达成协议，并按照公司章程的规定进行操作即可。
- 对外转让：股东也可以将股权转让给第三方。此时，需要经过其他股东过半数的同意，并且其他股东在同等条件下享有优先购买权。转让完成后，需要修改公司章程和股东名册。
公司回购股权：
- 在特定法定情形下，如公司连续五年不向股东分配利润且该五年连续盈利、公司合并、分立、转让主要财产等，股东可以请求公司按照合理价格收购其股权。
公司清算：
- 当公司解散时，需要进行清算。清算过程中，要成立清算组，清理公司财产、编制资产负债表和财产清单，通知、公告债权人，处理与清算有关的公司未了结的业务等。清偿公司债务后，如有剩余财产，有限责任公司按照股东的出资比例分配，股份有限公司按照股东持有的股份比例分配。
二、股东退出清算的具体步骤
查看公司章程：
- 首先，需要查看公司章程中关于股东退出的相关规定。章程可能对退股程序、退股价格的计算方法等有明确规定。
协商确定退股价格：
- 如果章程没有明确规定，股东可以与公司或其他股东进行协商，确定退股价格。协商时，可以考虑公司的经营状况、资产负债、未来发展潜力等因素。
进行资产审计评估：
- 为了确保退股价格的公平合理，可以聘请专业的会计师事务所对公司的资产、负债、经营状况等进行全面审计和评估。根据评估结果，计算出公司的净资产，并按照股东的持股比例确定退股金额。
处理特殊情况：
- 如果公司存在未了结的诉讼、潜在债务等情况，需要在清算时预留相应资金或明确责任承担方式。
签订退股协议：
- 确定退股价格和方式后，需要签订合法有效的退股协议。协议中应明确双方的权利义务、退股价格、支付方式、时间等关键条款。
办理工商变更登记：
- 退股完成后，需要及时办理工商变更登记手续，更新公司股东信息，以确保各方合法权益得到保障。
三、注意事项
- 在整个退出清算过程中，必须严格遵守法律法规和公司章程的规定，确保程序的合法性和合规性。
- 如果双方无法就退股价格或方式达成一致，可以考虑通过法律途径解决争议，如提起诉讼或申请仲裁。
希望以上解答能够帮助您更好地理解小店股东退出的清算方式及步骤。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时告诉我。