被冻结的单位存款在冻结期间应当计息，其法律依据主要来源于《储蓄管理条例》及相关司法解释。具体分析如下：
《储蓄管理条例》第二十五条
该条款明确规定：“对个人储蓄存款，商业银行有权拒绝任何单位或者个人查询、冻结、扣划，但法律另有规定的除外。对单位存款，商业银行有权拒绝任何单位或者个人查询，但法律、行政法规另有规定的除外；有权拒绝任何单位或者个人冻结、扣划，但法律另有规定的除外。”
虽然该条款未直接提及“计息”，但其立法精神在于保护存款人的合法权益，包括存款利息的获取权。冻结存款仅限制资金的使用权，并不改变存款的所有权及利息计算规则。
《最高人民法院关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》第二十九条
该司法解释规定：“冻结银行存款及其他资金的期限不得超过六个月。申请执行人申请延长期限的，人民法院应当在查封、扣押、冻结期限届满前办理续行查封、扣押、冻结手续，续行期限不得超过前款规定期限的二分之一。”
此条款虽未直接涉及计息问题，但明确了冻结的期限限制，间接支持了冻结期间存款权利（包括利息）的持续性。若冻结期间不计息，则可能构成对存款人权益的不当侵害。
《商业银行法》第三十三条
该法条规定：“商业银行应当保证存款本金和利息的支付，不得拖延、拒绝支付存款本金和利息。”
此条款直接确立了商业银行支付存款利息的法定义务。冻结存款属于司法强制措施，但并未免除商业银行的计息义务。若冻结期间不计息，则商业银行可能违反该法条规定的支付义务。
实务建议：
若单位发现其被冻结的存款在冻结期间未被计息，可首先与冻结机关（如法院）及商业银行沟通，要求依据上述法律规定补计利息。若沟通无果，可通过法律途径主张权利，包括但不限于提出执行异议或提起诉讼。
总结：被冻结的单位存款在冻结期间应当计息，这是基于保护存款人合法权益、维护金融秩序的立法目的所决定的。如有进一步疑问，可直接向我咨询。