您好，针对您提出的“刑事案件已经提交程序办结后怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
刑事案件在程序办结，即结案后，通常会进入后续的司法程序或执行阶段，这一阶段涉及多个方面的处理，以确保司法程序的完整性和公正性。
刑罚执行阶段：
- 如果被告人被判处了刑罚，那么就会进入刑罚执行阶段。刑罚包括主刑（如管制、拘役、有期徒刑、无期徒刑、死刑）和附加刑（如罚金、剥夺政治权利、没收财产）。
- 执行机关会根据判决内容，将被告人交付至相应的场所执行刑罚，如监狱、看守所等，确保刑罚的准确执行。
涉案财物处理：
- 对于涉案财物，会进行清理和处置。属于被害人的合法财产，会及时返还给被害人，以保障其合法权益。
- 违禁品和供犯罪所用的本人财物，则会被依法没收，上缴国库或进行其他合法处理。
附带民事诉讼执行：
- 如果案件中存在附带民事诉讼，那么会根据判决结果进行赔偿执行等相关事宜。
- 执行机关会确保判决中的赔偿金额得到有效执行，保障被害人的民事权益得到实现。
案件材料归档：
- 结案后，案件材料会被进行归档保存，成为司法档案的一部分。
- 归档工作会严格按照规定进行，确保档案的完整性和可查性，为后续司法工作提供准确依据。
在处理刑事案件结案后的相关事宜时，还需要注意以下几点：
- 确保执行机关严格按照判决内容执行：防止出现违规或延误执行的情况，保障刑罚的准确执行。
- 明确区分涉案财物：及时准确地进行返还和没收操作，避免财物处理出现混乱或错误。
- 加强附带民事诉讼的执行力度：确保判决结果能够得到有效执行，保障被害人的合法权益得到充分实现。
- 严格按照规定进行案件材料归档：确保档案的完整性和可查性，为后续司法工作提供有力支持。
综上所述，刑事案件结案后的处理涉及多个方面，需要执行机关、被害人、被告人等多方共同参与和配合，以确保司法程序的完整性和公正性。希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。