针对您提出的“刑事案件扣押的车辆与案件无关且是未成年租来的怎么处理”这一问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：
一、车辆与案件无关的处理原则
根据《刑事诉讼法》的相关规定，如果扣押的车辆经调查后确认与案件无关，那么公安机关应当在三日以内解除扣押，并将车辆归还给车主或合法使用人。这是法律对于无关财产保护的基本原则，旨在避免无辜财产受到不必要的扣押和损失。
二、未成年租车的特殊情况
租车行为的合法性：
- 首先，需要确认未成年租车这一行为本身是否合法。根据相关法律法规，未成年人可能因年龄限制而无法独立签订租车合同。如果租车合同因未成年人年龄问题而无效，那么租车行为本身可能存在法律瑕疵。但这并不影响车辆作为财产本身的归属和返还问题。
车辆返还的申请：
- 既然车辆与案件无关，且您（或未成年人的监护人）作为车辆的实际使用人或合法承租人，有权向扣车的公安机关申请返还车辆。申请时，您需要提供相关证明材料，如租车合同（尽管可能存在法律瑕疵，但可作为使用证明）、行驶证、以及未成年人的身份证明和监护人的授权文件等。
三、申请返还车辆的具体步骤
准备证明材料：
- 收集并整理好所有与车辆相关的证明材料，包括租车合同、行驶证、未成年人的身份证明、监护人的身份证明和授权文件等。
向公安机关提出申请：
- 携带上述证明材料，前往采取扣押措施的公安机关，向负责案件的民警或相关部门提出返还车辆的申请。
等待公安机关处理：
- 公安机关在收到申请后，会进行进一步的审查和核实。如果确认车辆与案件无关，且您提供的证明材料齐全有效，那么公安机关应当在三日以内解除扣押，并将车辆归还给您。
四、注意事项
- 保持沟通：在申请返还车辆的过程中，与公安机关保持密切沟通，及时了解案件进展和车辆返还的最新情况。
- 法律援助：如果您在处理过程中遇到法律难题或需要进一步的法律帮助，可以考虑咨询专业律师或寻求法律援助机构的支持。
综上所述，如果刑事案件扣押的车辆与案件无关且是未成年租来的，您（或未成年人的监护人）有权向扣车的公安机关申请返还车辆。在申请过程中，请准备好相关证明材料，并与公安机关保持密切沟通。