结论：用工单位在劳动合同到期后要求员工从九小时工作制改为十二小时工作制，这一行为是否合法，需根据具体情况判断，但通常情况下，未经双方协商一致，单方面延长工作时间是不合法的。
一、劳动合同的约定与变更
劳动合同的约束力：
- 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。一旦签订，双方均应按照合同约定履行各自的义务。
- 在您的情况下，劳动合同中明确约定了工作时间为九小时，这是双方协商一致的结果，具有法律约束力。
劳动合同的变更：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同的变更应当遵循平等自愿、协商一致的原则。
- 如果用工单位希望变更劳动合同中的工作时间条款，应当与劳动者进行协商，并达成一致意见。未经协商一致，单方面变更劳动合同是不合法的。
二、工作时间的法律规定
标准工作时间：
- 根据《劳动法》的规定，国家实行劳动者每日工作时间不超过八小时、平均每周工作时间不超过四十四小时的工时制度。
- 当然，也存在综合计算工时制和不定时工作制等特殊工时制度，但这些都需要经过劳动行政部门的批准，并且不能违反法律关于劳动者休息权的规定。
延长工作时间的限制：
- 即使因为生产经营需要延长工作时间，也应当与工会和劳动者协商，并一般每日不得超过一小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下延长工作时间每日不得超过三小时，但是每月不得超过三十六小时。
- 在您的情况下，用工单位要求从九小时延长至十二小时，显然超出了法律规定的延长工作时间限制。
三、可能的法律后果与建议
法律后果：
- 如果用工单位未经协商一致单方面延长工作时间，劳动者有权拒绝执行，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 用工单位可能面临劳动行政部门的处罚，包括警告、罚款等。
建议：
- 与用工单位协商：首先，您可以尝试与用工单位进行协商，表达您对于工作时间变更的看法和担忧，寻求双方都能接受的解决方案。
- 拒绝非法要求：如果协商无果，您有权拒绝用工单位的非法要求，并保留相关证据以备后续维权之需。
- 寻求法律援助：如果用工单位坚持非法要求，并且对您的权益造成了损害，您可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，必要时也可以寻求法律援助或咨询专业律师。
总结：用工单位在劳动合同到期后要求员工从九小时工作制改为十二小时工作制，这一行为通常是不合法的。您有权拒绝这一非法要求，并可以通过协商、投诉或申请劳动仲裁等方式来维护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。