针对您提出的“最高院执行清偿顺序先本后息与民法典先息后本矛盾时怎么处理”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：
一、理解两种清偿顺序的背景与原则
先本后息原则：
- 主要体现在最高人民法院的相关司法解释中，特别是关于执行程序中计算迟延履行期间的债务利息的规定。
- 这一原则强调，在执行款不足以清偿全部债务时，应先清偿生效法律文书确定的金钱债务（即本金），如果有剩余，再支付迟延履行利息。
- 其背后的理念是，迟延履行利息虽名为利息，但实则具有一定公法性质，是对当事人迟延履行金钱债务的一种惩罚，因此应后于本金受偿。
先息后本原则：
- 主要体现在一般民事债权的清偿中，如《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国合同法〉若干问题的解释(二)》等规定。
- 这一原则强调，在债务人的给付不足以清偿全部债务时，且当事人没有约定的情况下，应按照实现债权的有关费用、利息、主债务的顺序进行抵充。
- 其背后的理念是公平和保护债权人的利益，确保债权人的经济损失得到弥补。
二、分析两种原则在执行程序中的适用
执行程序中的特殊性：
- 执行程序中的清偿顺序与一般民事债权清偿有所不同，因为执行程序涉及的是对生效法律文书的履行，具有更强的公法性质。
- 迟延履行利息作为执行措施的一种，其计算与支付均受到严格规定，旨在督促被执行人尽快履行判决义务。
两种原则的协调：
- 在执行程序中，当执行款不足以清偿全部债务时，应优先适用最高人民法院司法解释中规定的先本后息原则。
- 这并不意味着先息后本原则在执行程序中完全不适用，而是在特定情境下（如一般民事债权的清偿），先息后本原则仍然有效。
- 关键在于区分执行程序中的债务清偿与一般民事债权的清偿，以及理解迟延履行利息的特殊性质。
三、处理矛盾的具体方法
遵循司法解释的规定：
- 在执行程序中，应严格按照最高人民法院的相关司法解释执行，即先清偿生效法律文书确定的金钱债务，再清偿迟延履行利息。
尊重当事人的约定：
- 如果当事人对清偿顺序有另行约定，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，应尊重当事人的约定。
综合考量公平与效率：
- 在处理具体案件时，法院应综合考量公平与效率的原则，确保债权人的合法权益得到保护，同时兼顾执行程序的效率和可行性。
四、结论
综上所述，当最高院执行清偿顺序中的先本后息原则与民法典中的先息后本原则出现矛盾时，在执行程序中应优先适用最高人民法院司法解释中规定的先本后息原则。这是因为执行程序具有其特殊性，且迟延履行利息作为执行措施的一种，具有更强的公法性质。同时，我们也应尊重当事人的约定，并在处理具体案件时综合考量公平与效率的原则。