在起诉离婚后，如果双方达成协议，法院是可以制作调解书结案的。以下是对此问题的详细分析：

一、调解结案的法律依据

根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，人民法院审理民事案件，根据当事人自愿的原则，在事实清楚的基础上，分清是非，进行调解。在离婚案件中，如果双方当事人在诉讼过程中就子女抚养、财产分割以及债务处理等事项达成一致意见，并愿意通过调解方式解决纠纷，法院可以依法制作调解书，确认双方达成的协议内容，并以此作为结案的依据。

二、调解结案的具体流程

1. 双方协商：在起诉离婚后，双方当事人可以就离婚相关事宜进行协商，并尝试达成一致意见。
2. 申请调解：如果双方达成协议，可以向法院申请调解。此时，需要提交调解申请书，并附上双方达成的协议内容。
3. 法院审查：法院会对双方提交的调解申请书和协议内容进行审查。如果审查通过，法院会安排调解程序。
4. 制作调解书：在调解过程中，如果双方确认协议内容无误，并愿意按照协议内容履行义务，法院会依法制作调解书。调解书经双方当事人签收后，即具有法律效力。
5. 结案：调解书制作并送达双方当事人后，法院会以此作为结案的依据，并终结诉讼程序。

三、调解结案的优势

1. 节省时间和成本：与判决相比，调解结案通常更加迅速和高效，可以节省双方当事人的时间和诉讼成本。
2. 维护双方关系：调解结案有助于维护双方当事人的关系，避免因为诉讼而产生的对立和冲突。
3. 灵活性高：调解过程中，双方当事人可以更加灵活地协商和解决纠纷，达成更加符合双方利益的协议。

四、注意事项

1. 确保协议内容合法：在达成协议时，双方当事人需要确保协议内容合法、有效，并符合法律法规的规定。否则，法院可能不会确认协议内容，并导致调解失败。
2. 认真履行调解书：调解书具有法律效力，双方当事人需要认真履行调解书所确定的义务。如果一方不履行调解书所确定的义务，另一方可以向法院申请强制执行。

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