弟弟在法院可以追回被哥哥侵吞的大部分资金，但具体能否追回及追回的数额，需根据实际情况和法律规定来判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

一、法律背景与依据

1. 继承权：根据《中华人民共和国民法典》继承编的相关规定，被继承人去世后，其遗产应由法定继承人继承。在母亲去世的情况下，哥哥和弟弟作为法定继承人，均有权继承母亲的遗产。

2. 遗产分配原则：在遗产分配过程中，应遵循平等、公平的原则。除非有特别约定或法律规定的特殊情况（如对被继承人尽了主要扶养义务或与被继承人共同生活的继承人可以多分），否则各继承人应平均分配遗产。

3. 侵吞遗产的法律责任：如果哥哥侵吞了大部分资金，这可能构成对弟弟继承权的侵害。弟弟有权依法要求哥哥返还侵吞的遗产，并可能要求哥哥承担相应的法律责任。

二、可能的情况与建议

1. 哥哥侵吞遗产的事实明确：

   • 如果弟弟能够提供充分的证据证明哥哥侵吞了大部分资金（如银行转账记录、证人证言等），那么弟弟在法院提起诉讼时，胜诉的可能性较大。
   • 在此情况下，弟弟可以要求法院判决哥哥返还侵吞的遗产，并可能要求哥哥支付相应的利息或赔偿。

2. 哥哥侵吞遗产的事实存在争议：

   • 如果弟弟无法提供充分的证据证明哥哥侵吞了遗产，或者哥哥对侵吞行为提出抗辩（如认为资金已用于母亲的后事处理等），那么案件的处理可能会更加复杂。
   • 在此情况下，弟弟需要积极收集证据，证明自己的继承权受到侵害，并可能需要通过调解、仲裁或诉讼等方式来解决争议。

3. 遗产分配协议的存在：

   • 如果母亲在生前或去世后，继承人之间达成了遗产分配协议，并且该协议合法有效，那么应按照协议来分配遗产。
   • 如果哥哥违反了协议，侵吞了大部分资金，弟弟可以依据协议要求哥哥返还侵吞的遗产。

三、法律程序与建议

1. 收集证据：弟弟应积极收集与遗产分配相关的证据，如银行转账记录、证人证言、遗产分配协议等。

2. 协商与调解：在提起诉讼前，弟弟可以尝试与哥哥进行协商或调解，以寻求和解的可能性。

3. 提起诉讼：如果协商或调解无果，弟弟可以向法院提起诉讼，要求哥哥返还侵吞的遗产。在诉讼过程中，弟弟应提供充分的证据来支持自己的主张。

4. 执行判决：如果法院判决哥哥返还侵吞的遗产，但哥哥拒不履行判决，弟弟可以向法院申请强制执行。

最后需要强调的是，每个案件的具体情况都有所不同，因此在实际操作中，弟弟应根据自己的实际情况和法律规定来采取相应的法律措施。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。