结论：建设工程同时违反《建筑工程施工许可管理办法》和《消防法》时，处罚需结合具体违法情形，可能面临责令停工、罚款、没收违法所得、责令改正等行政处罚，甚至承担刑事责任。以下分情况说明：

1. 未取得施工许可证擅自施工（违反《建筑工程施工许可管理办法》）

• 处罚依据：根据《建筑工程施工许可管理办法》第十二条，未取得施工许可证擅自施工的，责令停止施工，限期改正，对建设单位处工程合同价款1%以上2%以下罚款；对施工单位处3万元以下罚款。
• 关键点：处罚对象包括建设单位和施工单位，罚款比例与工程合同价款挂钩，需结合具体合同金额计算。

2. 违反消防法规（如未通过消防验收、擅自投入使用）

• 处罚依据：根据《消防法》第五十八条，违反消防设计审核、验收或备案规定的，责令停止施工、停止使用或停产停业，并处3万元以上30万元以下罚款。
• 关键点：若工程未通过消防验收即投入使用，可能面临更高额罚款，且需立即停工整改。

3. 同时违反两法的叠加处罚

• 处罚原则：行政机关可依据不同法律条款分别处罚，但需遵循“一事不再罚”原则（即对同一违法行为不重复处罚）。若违法行为涉及不同环节（如未取证施工+未通过消防验收），则可能叠加处罚。
• 典型情形：
  • 建设单位未取证施工且未办理消防设计审核，可能被住建部门和消防部门分别处罚；
  • 施工单位参与无证施工且未按消防标准施工，可能面临双重罚款。

4. 情节严重时的刑事责任

• 依据：若违法行为导致重大安全事故（如火灾、坍塌），可能触犯《刑法》第一百三十七条（工程重大安全事故罪）或第一百三十四条（重大责任事故罪），相关责任人可能被处五年以下有期徒刑或拘役。

建议

1. 立即停工整改：避免处罚进一步升级；
2. 补办手续：尽快申请施工许可证和消防验收；
3. 协商处理：与行政机关沟通，争取从轻或减轻处罚；
4. 法律审查：若对处罚有异议，可申请行政复议或提起行政诉讼。

提示：具体处罚需结合工程规模、违法情节、是否造成危害后果等因素综合判定。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件细节。