工程建设变更签证并不直接适用政府采购法中关于变更签证的条款，而是应依据建设工程相关法律法规及合同约定来处理。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、法律适用范围

1. 政府采购法：主要规范政府采购行为，包括采购方式、程序、合同管理等。它侧重于政府采购活动的整体框架和规则，并不直接针对建设工程变更签证这一具体环节。
2. 建设工程法律法规：如《中华人民共和国建筑法》、《建设工程质量管理条例》等，这些法律法规专门针对建设工程活动，包括工程变更、签证、结算等环节。因此，工程建设变更签证应主要依据这些法律法规来处理。

二、变更签证的法律依据

1. 合同约定：在建设工程合同中，通常会明确约定工程变更、签证的程序和要求。当工程发生变更时，各方应按照合同约定进行签证，以明确变更内容、费用调整等事项。
2. 建设工程法律法规：除了合同约定外，建设工程法律法规也对工程变更、签证等环节进行了规定。例如，对于必须进行招标的工程项目，其变更签证可能还需要遵循招标投标法的相关规定。

三、实际操作建议

1. 明确合同条款：在签订建设工程合同时，应明确约定工程变更、签证的程序和要求，包括变更的提出、审批、实施、结算等环节。这有助于在工程发生变更时，各方能够按照合同约定进行操作，减少纠纷。
2. 遵守法律法规：在进行工程变更签证时，应遵守相关法律法规的规定，确保签证的合法性和有效性。例如，对于必须进行招标的工程项目，其变更签证应经过招标投标程序的认可。
3. 及时沟通协作：工程变更签证涉及多方主体，包括建设单位、设计单位、施工单位等。各方应及时沟通协作，共同处理变更签证事宜，确保工程顺利推进。

四、特殊情况下的处理

在某些特殊情况下，如工程合同中有特别约定，或者法律法规有特别规定，对于一些细微的、不涉及费用和重大技术问题的工程变更，可能可以不进行签证。但这种情况相对较少，且需严格遵循合同约定和法律法规的规定。