针对您提出的“亲子鉴定不是男方孩子怎么上户口”的问题，这确实是一个涉及法律程序和户籍管理规定的复杂情况。以下是我为您整理的详细解答：

一、理解亲子鉴定与上户口的关系

首先，需要明确的是，亲子鉴定在上户口的过程中，主要是用于证明亲子关系的真实性。当出生证明缺失、父母信息不全或存在其他特殊情况（如非婚生子女、领养、再婚家庭等）时，户籍管理部门可能要求提供亲子鉴定报告以确认亲子关系。

二、非男方亲子关系的上户口流程

1. 选择正规鉴定机构：

   • 必须选择具有司法鉴定资质的机构进行亲子鉴定，这样的鉴定报告才具有法律效力。
   • 可以通过当地司法局官网查询合法机构名单，确保选择正规机构。

2. 准备相关材料：

   • 母亲和孩子的身份证、户口本（如无身份证，需提供出生证明或其他有效证件）。
   • 如果可能，提供与男方（非生物学父亲）的婚姻证明或相关法律文件，以说明情况。
   • 司法鉴定委托书（部分机构可协助办理）。

3. 进行亲子鉴定：

   • 母亲和孩子需一同到场，由工作人员采集血样或口腔拭子。
   • 采样过程简单快捷，通常只需几分钟，无痛无创。

4. 等待鉴定结果：

   • 一般5-7个工作日出报告，加急可缩短至2-3天。
   • 鉴定报告会加盖司法鉴定专用章，具备法律效力。

5. 办理户口登记：

   • 携带鉴定报告、母亲和孩子的身份证、户口本等材料，前往当地派出所。
   • 向户籍管理部门说明情况，即孩子与男方无生物学关系，但需要按照法律规定上户口。
   • 户籍管理部门会根据鉴定报告和其他相关材料，审核并办理落户手续。

三、注意事项

1. 选择司法鉴定机构：

   • 必须选择司法鉴定机构进行亲子鉴定，普通个人亲子鉴定报告不能用于上户口。

2. 所有被鉴定人需亲自到场：

   • 母亲和孩子需亲自到场进行采样，不可邮寄样本。

3. 了解当地政策：

   • 不同地区的户籍管理政策可能有所不同，建议提前咨询当地派出所或户籍管理部门，了解具体的上户口要求和流程。

4. 准备充分材料：

   • 提前准备好所有需要的材料，避免因手续不全耽误时间。

四、特殊情况处理

• 如果孩子是非婚生子女，且生物学父亲无法参与鉴定或不愿承认亲子关系，母亲可以单独携带孩子进行亲子鉴定，并按照上述流程办理上户口手续。但需要注意的是，这种情况下可能需要提供更多的法律文件或证明来支持上户口的申请。

五、法律建议

• 在处理此类复杂情况时，建议咨询专业的律师或法律机构，以确保您的权益得到充分保护，并遵循正确的法律程序。

希望这份详细的解答能帮助您理解在非男方亲子关系情况下如何上户口的流程和要求。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时咨询。