公司与公司之间借款，在遵守相关法律法规、确保借款合同依法订立且借款用途合法的前提下，是合法的。以下从不同角度为您详细分析：
一、合法性基础与条件
合法性基础：
- 根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》第一条，民间借贷包括法人之间、非法人组织之间以及它们相互之间为生产、经营需要订立的民间借贷合同。因此，公司之间的借款属于民间借贷的范畴，法律并不禁止。
合法条件：
- 借款合同依法订立：借款合同必须体现双方真实意思，且内容不违反法律、行政法规的强制性规定。例如，合同中不得存在非法集资、套取金融机构贷款转贷等违法情形。
- 借款用途合法：借款应专用于公司的生产、经营活动，不得用于非法或违规目的。如将借款用于赌博、贩毒等违法犯罪活动，则借款合同可能被认定无效。
- 不存在无效情形：根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》第十三条，具有下列情形之一的，人民法院应当认定民间借贷合同无效：
- 套取金融机构信贷资金又高利转贷给借款人，且借款人事先知道或者应当知道的；
- 以向其他营利法人借贷或者向本单位职工集资取得的资金又转贷给借款人牟利，且借款人事先知道或者应当知道的；
- 出借人事先知道或者应当知道借款人借款用于违法犯罪活动仍然提供借款的；
- 违背社会公序良俗的；
- 其他违反法律、行政法规效力性强制性规定的。
二、实际操作中的注意事项
签订书面借款合同：
- 公司间借款应签订书面借款合同，明确借款金额、用途、利息、还款时间等条款。这样能避免后续纠纷，保障双方权益。
利息约定要合法：
- 借贷双方约定的利率未超过合同成立时一年期贷款市场报价利率四倍的，出借人请求借款人按照约定的利率支付利息的，人民法院应予支持。过高的利率可能被认定为高利贷，从而受到法律制裁。
借款用途需合法合规：
- 借款用途必须合法合规，不能用于违法犯罪活动。否则，即使借款合同有效，相关行为也可能不受法律保护。
税务处理：
- 依据《中华人民共和国税收征收管理法》第三十六条，企业与其关联企业之间的业务往来应遵循独立交易原则。若借贷双方存在关联关系，税务机关有权核定其利息收入并缴纳相应的营业税和企业所得税。
内部决策程序：
- 公司对外借款需遵循《中华人民共和国公司法》及公司章程的规定，通常需由董事会或股东会、股东大会进行决议，以确保决策的合法性和合规性。
三、不合法或存在风险的情况
违反法律法规强制性规定：
非法金融活动：
- 未经金融监管部门批准，企业以借贷名义向社会公众发放贷款的行为可能涉嫌非法经营等违法犯罪活动。
建议：公司在进行借款时，务必确保借款合同的合法性和有效性，明确借款用途，并遵守相关法律法规和内部决策程序。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。