当电动自行车闯红灯与机动车发生碰撞时，处理这类事故需要遵循一定的法律程序和责任划分原则。以下是对此问题的详细解答：

一、立即报警并保护现场

首先，涉事人员应立即报警，以便警方能够迅速到达现场进行勘查和调查。同时，要保护好事故现场，不要随意移动车辆或破坏现场证据，这有助于后续的事故责任认定。

二、警方调查与责任认定

警方到达现场后，会进行详细的勘查和调查，包括询问涉事人员、查看监控录像、收集现场证据等。根据《道路交通事故处理程序规定》，公安机关交通管理部门会根据当事人的行为对发生道路交通事故所起的作用以及过错的严重程度，确定当事人的责任。

1. 若电动自行车闯红灯：

   • 如果电动自行车驾驶员违反交通信号灯规定闯红灯，并因此导致与机动车发生碰撞，那么电动自行车驾驶员通常需要承担主要责任或全部责任。

2. 若机动车无违规：

   • 如果机动车在事故发生时处于规范行驶状态，没有超速、无证驾驶、酒后驾车等违法违规行为，那么机动车驾驶员可能不承担责任或仅承担不超过百分之十的赔偿责任（针对超出保险赔偿范围的部分）。

三、保险公司赔偿与额外责任

根据《中华人民共和国道路交通安全法》和《道路交通安全法》的相关规定，机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险公司在机动车第三者责任强制保险责任限额范围内予以赔偿。如果保险赔偿不足，那么根据责任划分，涉事双方需要按照各自过错的比例分担剩余的经济损失。

• 保险公司赔偿：保险公司会根据保险合同和事故责任认定书进行赔偿。
• 额外责任：对于超出保险赔偿范围的部分，如果电动自行车驾驶员承担主要责任或全部责任，那么他们需要自行承担这部分损失。如果机动车驾驶员也有一定过错，那么他们可能需要承担不超过百分之十的赔偿责任。

四、法律教育与引导

此类事故不仅涉及责任划分和经济赔偿，更重要的是对涉事双方进行法律教育和引导。电动自行车驾驶员应认识到违反交通规则的严重性，机动车驾驶员也应保持警惕，遵守交通法规，确保行车安全。

五、特殊情况处理

如果事故中有人员受伤或成为植物人等严重后果，那么责任划分将更加复杂。在这种情况下，需要等待警方给出详尽的交通事故责任认定书，以此作为责任区分的重要依据。同时，涉事双方可能需要通过法律途径解决纠纷。

综上所述，当电动自行车闯红灯与机动车发生碰撞时，应立即报警并保护现场，等待警方调查与责任认定。根据责任划分和保险赔偿情况，涉事双方需要按照各自过错的比例分担经济损失。同时，我们也应从中吸取教训，遵守交通法规，确保行车安全。