当父母都不在，而需要鉴定兄妹关系时，确实会面临一些挑战，但仍有多种合法且有效的方式可以证明这种关系。以下是一些详细的建议和方法：

一、出生证明

出生证明是记录婴儿出生时基本信息的重要原始凭证，它包含了父母的姓名等关键信息，是证明亲属关系的直接证据。你可以尝试向出生时所在的医院或相关卫生健康部门申请查询和获取出生证明的副本。如果兄妹的出生证明上明确显示了共同的父母信息，那么这就可以作为证明两人兄妹关系的直接证据。

二、父母的相关证明材料

除了出生证明，父母的人事档案（如职工履历表）、书信、日记等也可能包含有关家庭成员关系的信息。你可以尝试联系父母原工作单位的人事部门或档案管理机构，查询并复印相关的人事档案，并请档案管理部门盖章确认其真实性。对于书信、日记等材料，你需要确保它们的真实性和可印证性。

三、亲属关系公证书

根据《中华人民共和国公证法》的规定，公证机构可以办理亲属关系的公证事项。你可以准备身份证、户口簿等身份证明材料，以及与兄妹关系相关的证明材料（如出生证明、父母的结婚证等），然后前往当地公证处提出申请。公证人员会审核你的材料，并进行必要的调查核实。审核无误后，公证处会出具亲属关系公证书，这份公证书具有法律效力，可以作为证明兄妹关系的有效凭证。

四、公安机关户籍档案

公安机关保留的户籍档案信息中可能也记录了兄妹之间的亲属关系。你可以向户籍所在地的公安机关提出查询申请，说明查询目的和理由。公安机关在核实信息后，会提供相应的户籍档案证明材料，这也可以作为证明兄妹关系的依据。

五、DNA亲子鉴定（间接证明）

虽然DNA亲子鉴定通常用于直接证明亲子关系，但在父母都不在的情况下，如果其他证明方式难以获取或存在争议，你也可以考虑通过DNA鉴定来间接证明兄妹关系。这需要兄妹双方共同到具有资质的司法鉴定机构进行，采集血液、毛发等生物样本进行检测分析。虽然鉴定报告的费用相对较高，但它具有科学性和准确性，可以作为有力的证据。

六、村委会或居委会证明

如果无法提供足够的材料办理亲属关系公证或需要进一步核实情况，你可以考虑向所在村委会或居委会申请出具书面证明。你需要携带身份证、户口本等相关材料前往申请，村委会或居委会在核实情况后，会出具书面证明。虽然这份证明的法律效力可能不及公证书，但在一些场合下仍可以作为有效凭证。

七、其他辅助证明材料

除了上述方法外，你还可以尝试调取自己或兄妹的个人档案、学历档案等，收集能证明亲属关系的表格或记录。如果出生医学证明上明确记载了兄妹关系，那么这也可以作为有力的证据。此外，家族族谱虽然不能作为直接的法律依据，但也可以作为辅助材料来证明兄妹关系，不过需要与其他证据相互印证。

在实际操作中，我建议你优先选择具有法律效力的证明方式，如亲属关系公证、公安机关户籍档案等。如果条件限制或存在特殊情况，你可以考虑其他辅助证明方式，并确保所收集的证据真实、合法、有效。希望这些建议能对你有所帮助。