发生交通事故扣车导致车辆被水淹，一般属于因交通事故引发的间接损失赔偿范畴，但具体赔偿情况需根据事故责任划分、保险条款以及实际损失情况来确定。以下从不同角度进行分析：
一、事故责任划分角度
若事故责任在对方：
- 根据《中华人民共和国民法典》侵权责任编的相关规定，因对方过错导致您车辆被扣且被水淹，对方应承担相应的赔偿责任。这包括车辆因水淹造成的直接损失（如维修费用）以及因车辆无法使用而产生的间接损失（如租车费用）。
- 您需要收集相关证据，如事故认定书、车辆被扣证明、水淹现场照片或视频、维修费用清单等，以证明您的损失与对方行为之间的因果关系。
若事故责任在您：
- 若事故责任在您，则您可能需要自行承担车辆被水淹的损失。但如果您购买了车辆损失险等相关保险，可以根据保险条款向保险公司申请理赔。
- 保险公司会根据保险合同的约定，对车辆因水淹造成的损失进行评估，并按照约定的比例进行赔付。
二、保险条款角度
交强险：
- 交强险主要赔偿因交通事故造成的人身伤亡和财产损失，但一般不包括车辆因被扣而导致的间接损失（如水淹损失）。然而，如果水淹导致了车辆直接损坏，且该损坏与交通事故有直接关联，交强险可能会在限额内进行赔付。
商业险：
- 如果您购买了车辆损失险、全车盗抢险等商业险，可以根据保险条款向保险公司申请理赔。车辆损失险通常覆盖因自然灾害（如洪水）造成的车辆损失。
- 但需要注意的是，保险条款中可能存在免责条款，如未按规定停放车辆导致的损失等。因此，在申请理赔前，您需要仔细阅读保险条款，了解保险公司的赔付范围和免责事项。
三、实际损失情况角度
直接损失：
- 直接损失包括车辆因水淹而需要进行的维修费用、更换零部件费用等。这些费用可以通过维修发票、更换零部件清单等证据来证明。
间接损失：
- 间接损失可能包括因车辆无法使用而产生的租车费用、交通费用等。这些损失虽然难以直接量化，但如果您能提供相关证据（如租车合同、交通费用发票等），也可以向责任方或保险公司主张赔偿。
法律建议
及时收集证据：在事故发生后，您应及时收集相关证据，如事故认定书、车辆被扣证明、水淹现场照片或视频、维修费用清单等，以证明您的损失与事故之间的因果关系。
与责任方或保险公司协商：在收集到足够证据后，您可以与责任方或保险公司进行协商，要求其承担相应的赔偿责任。如果协商无果，您可以考虑通过法律途径解决纠纷。
咨询专业律师：在处理此类复杂纠纷时，建议您咨询专业律师的意见。律师可以根据您的具体情况，为您提供专业的法律建议和帮助。
如有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。