结论：员工出钱但股份登记在总裁名下的做法，在法律上存在显著风险，并不被推荐。若确实存在此类安排，必须确保有合法、有效的协议明确双方权利义务，以避免潜在的法律纠纷。
法律分析：
股权归属问题：
- 股权是股东对公司享有的权利，包括财产权和参与管理权等。股权的归属应以工商登记为准，这是股权权属的法定证明方式。
- 若员工出钱但股份登记在总裁名下，从法律上讲，该股份属于总裁所有，员工可能面临无法证明其股东身份的风险。
潜在法律风险：
- 权益受损风险：员工可能因无法证明其股东身份而无法享受股东权益，如分红、投票权等。
- 纠纷风险：若总裁与员工之间发生纠纷，如总裁擅自处置股份，员工可能难以维权。
- 税务风险：此类安排可能涉及税务问题，如员工出资是否被视为对总裁的赠与，是否需要缴纳相关税费等。
合法协议的重要性：
- 若确实存在员工出钱但股份登记在总裁名下的情况，双方应签订合法、有效的协议，明确双方的权利义务，包括股份的实际归属、分红方式、处置权等。
- 协议应符合相关法律法规的规定，避免因违反法律而无效。
建议与操作：
- 避免此类安排：从法律风险和权益保障的角度出发，建议避免此类股份登记在他人名下的安排。
- 合法登记：若员工希望成为公司股东，应通过合法途径进行股权登记，确保其股东身份得到法律认可。
- 咨询专业律师：在涉及股权等复杂法律问题时，建议咨询专业律师，以确保自身权益得到充分保障。
举例说明：
假设某公司总裁A与员工B协商，由B出资购买公司股份，但股份登记在A名下。若双方未签订合法协议，一旦A擅自处置股份或拒绝向B分配分红，B可能因无法证明其股东身份而难以维权。相反，若双方签订了合法协议，明确B为实际股东，享有分红权等股东权益，则B的权益将得到更好保障。
后续行动建议：
- 若您或您所在的公司存在此类情况，建议立即咨询专业律师，评估法律风险，并考虑签订合法协议以明确双方权利义务。
- 在未来进行股权交易或安排时，务必确保符合相关法律法规的规定，避免因违反法律而引发不必要的法律纠纷。
如有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。