实际控制人在员工不按规定作业导致重大事故的情况下，是否承担刑事责任，需根据具体情况判断，但存在承担刑事责任的可能性。以下从不同角度进行分析：

一、实际控制人可能承担刑事责任的情况

1. 存在直接指挥或强令行为：

   • 如果实际控制人直接指挥员工不按规定作业，或者强令员工冒险作业，导致重大事故发生，那么实际控制人可能构成“强令、组织他人违章冒险作业罪”。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，强令他人违章冒险作业，或者明知存在重大事故隐患而不排除，仍冒险组织作业，因而发生重大伤亡事故或者造成其他严重后果的，处五年以下有期徒刑或者拘役；情节特别恶劣的，处五年以上有期徒刑。

2. 存在管理过失：

   • 实际控制人作为公司的管理者，有义务确保公司的安全生产。如果实际控制人未履行安全管理职责，如未制定或执行有效的安全生产规章制度、未提供必要的安全生产条件等，导致员工不按规定作业并引发重大事故，那么实际控制人可能因管理过失而承担刑事责任。这种情况下，可能构成“重大责任事故罪”或其他相关罪名。

二、实际控制人可能不承担刑事责任的情况

1. 无直接指挥或强令行为，且已尽管理职责：

   • 如果实际控制人没有直接指挥或强令员工不按规定作业，且已经履行了安全管理职责，如制定了完善的安全生产规章制度、提供了必要的安全生产条件等，但员工仍违反规定作业并导致重大事故发生，那么实际控制人可能不承担刑事责任。但需要注意的是，实际控制人仍需承担民事赔偿责任等。

2. 事故由不可抗力或第三方原因导致：

   • 如果重大事故是由不可抗力（如自然灾害）或第三方原因（如其他公司的违规行为）导致的，且实际控制人无法预见、无法避免且无法克服，那么实际控制人可能不承担刑事责任。

三、法律建议

1. 加强安全管理：

   • 实际控制人应加强对公司的安全管理，制定并执行有效的安全生产规章制度，提供必要的安全生产条件，确保员工按规定作业。

2. 及时应对事故：

   • 一旦发生重大事故，实际控制人应立即采取措施进行救援和处置，并配合相关部门的调查和处理工作。

3. 寻求法律帮助：

   • 如果实际控制人面临刑事指控或民事赔偿等法律问题，应及时寻求专业律师的帮助，以维护自己的合法权益。

在实际操作中，每个案件的具体情况都有所不同，因此实际控制人是否承担刑事责任还需根据具体案件的事实和证据进行判断。如果你或你的公司面临类似问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。