当被害人不同意被告人办理的提存保证金手续时，这通常发生在犯罪嫌疑人或被告人有赔偿意愿，但因被害人提出的诉求不合理、双方矛盾激化或无法联系到被害人，导致无法直接达成赔偿谅解的情况下。针对这一问题，不同地区已经探索并实施了赔偿保证金提存公证制度，以下是一个详细的申请流程及建议：
一、了解赔偿保证金提存公证制度
首先，您需要了解赔偿保证金提存公证制度的基本内容和目的。该制度旨在在公平规范的基础上，通过公证机构提存赔偿保证金，来修复和化解社会矛盾。它允许犯罪嫌疑人在无法直接与被害人达成赔偿谅解的情况下，通过缴纳一定数额的赔偿保证金来展示其赔偿意愿和认罚表现。
二、确认案件适用性
在申请前，您需要确认您的案件是否适用赔偿保证金提存公证制度。通常，该制度适用于人身伤害类案件或轻微刑事案件，其中犯罪嫌疑人主观恶性小、有赔偿能力且有赔偿意愿，但因各种原因无法与被害人直接达成赔偿谅解。
三、向办案机关表达赔偿意愿
接下来，您或您的法定代理人、近亲属、辩护人需要向公安机关或检察机关表达赔偿意愿。这可以通过书面申请或口头陈述的方式进行，并明确表示您愿意按照赔偿保证金提存公证制度的要求缴纳赔偿保证金。
四、缴纳赔偿保证金并获取公证书
在得到办案机关的指导后，您需要前往指定的公证机构缴纳赔偿保证金。公证机构会出具《公证书》作为缴纳凭证，证明您已经按照要求缴纳了赔偿保证金。
五、申请办案机关采取相应措施
持有《公证书》后，您可以向办案机关申请采取相应措施，如不批准逮捕、不起诉、变更强制措施或建议法院从轻处罚等。办案机关会根据案情及案件所处诉讼阶段，结合您缴纳的赔偿保证金情况，作出相应的决定。
六、针对被害人不同意的应对措施
加强沟通与解释：尽管被害人不同意提存保证金手续，但您仍可以尝试通过办案机关或第三方调解机构与被害人进行沟通，解释提存保证金制度的目的和意义，以及它对您和被害人双方的潜在好处。
尊重被害人意愿：如果被害人坚决不同意提存保证金，您需要尊重其意愿，并考虑其他赔偿和解方式，如直接赔偿、通过法院调解等。
关注案件进展：在等待案件处理的过程中，您需要密切关注案件的进展，并与办案机关保持联系，以便及时了解案件动态和采取相应措施。
七、法律建议与咨询
在整个过程中，如果您对法律程序或赔偿保证金提存公证制度有任何疑问或需要进一步的法律建议，您可以咨询专业的律师或法律援助机构。他们可以为您提供详细的法律解释和个性化的法律建议，帮助您更好地应对当前的情况。
总之，当被害人不同意被告人办理的提存保证金手续时，您可以通过了解并适用赔偿保证金提存公证制度来展示您的赔偿意愿和认罚表现。同时，您也需要尊重被害人的意愿，并考虑其他赔偿和解方式。在整个过程中，保持与办案机关的沟通并咨询专业律师的建议是非常重要的。