在承包工程中，预付款的支付并非法律强制要求，而是基于合同双方的约定及工程实际情况来决定。以下是对这一问题的详细分析：
一、法律层面分析
无强制规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》及相关建设工程法律法规，并未明确规定建设单位必须向承包单位支付预付款。这体现了合同自由原则，即预付款的支付需由双方在合同中自愿约定。
合同约定优先：
- 预付款的支付与否、支付比例及支付条件等，均应由合同双方在合同中明确约定。如果合同中有明确约定，则双方应按照合同约定执行。
二、行业惯例与实际操作
常见做法：
- 在实际操作中，支付预付款是建筑工程行业的常见做法。尤其对于规模较大、工期较长、前期资金投入较大的工程项目，预付款有助于承包单位进行必要的准备工作，如采购原材料、租赁设备、组织施工人员等。
- 一般情况下，工程预付款比例发包人应按不低于工程价款的60%，不高于工程价款的90%向承包人支付工程进度款（具体比例可能因地区、项目类型等因素而有所不同）。按约定时间发包人应扣回的预付款，与工程进度款同期结算抵扣。
不支付情况：
- 对于一些小型、工期短的工程项目，或承包单位有足够自有资金或通过其他融资渠道满足前期资金需求的情况，双方可能不约定预付款。
- 此外，建设单位基于对承包单位的信任或自身资金安排，也可能选择不支付预付款。
三、风险考虑与建议
建设单位风险：
- 支付预付款可能面临承包单位不履行合同义务、拖延工期甚至携款跑路的风险。为降低风险，建设单位应在合同中明确预付款的使用条件、支付方式、支付时间及违约责任等条款，并加强对承包单位资金使用的监督。
承包单位风险：
- 若未获得预付款，承包单位可能面临前期资金压力大、需要自行垫付大量资金的问题，影响工程进度和资金周转。因此，承包单位应在合同签订前充分评估自身资金状况，并与建设单位协商合理的预付款条款。
协商一致与合同明确：
- 无论是否支付预付款，双方都应通过协商一致并在合同中明确相关条款。合同应详细规定预付款的金额、支付方式、支付时间、使用条件及违约责任等，以确保双方权益得到保障。
四、特殊情形下的预付款处理
政府投资项目：
- 对于政府投资项目，部分地方政府可能出台管理规定限制或禁止预付款的支付，以加强财政资金管理和监督。然而，在特定情况下，经过严格审批程序，也可能允许支付预付款。
发票与预付款的关系：
- 发票是买卖双方交易过程中的一种凭证，用于证明交易的发生和货款的支付情况。然而，发票本身并不具有预付款的性质，它只是交易的一种记录方式。因此，仅凭发票并不能直接判定一笔款项为预付款。判断的关键在于双方签订的合同条款以及实际的交易情况。
总结与建议：
在承包工程中，预付款的支付需根据具体情况而定。双方应充分考虑工程规模、工期、资金需求及风险等因素，通过协商一致并在合同中明确预付款的相关条款。这样既能保障承包单位的利益，又能确保工程的顺利进行。如果您在承包工程中遇到预付款相关的问题或争议，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。