在非法制造枪支案中，存在可以免于起诉的情形，但具体需依据案件情况和法律规定综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、法定不起诉情形
根据《刑事诉讼法》的相关规定，以下情形将不追究刑事责任，已追究的应撤销案件、不起诉、终止审理或宣告无罪：
- 情节显著轻微、危害不大：例如，若非法制造的枪支部件缺失且无法击发，经鉴定不具备枪支性能，且行为人主动上交后，可视为情节显著轻微，不构成犯罪，从而免于起诉。
- 犯罪已过追诉时效期限：根据《刑法》第八十七条，若非法制造枪支的行为已超过法定的追诉时效，则不再追究刑事责任。
- 经特赦令免除刑罚：若犯罪嫌疑人属于国家特赦对象，则应免除其刑罚，从而免于起诉。
- 犯罪嫌疑人、被告人死亡：在诉讼过程中，若犯罪嫌疑人死亡，应作出不起诉决定。
- 其他法律规定免予追究刑事责任：如有其他法律特别规定，也可免于追究刑事责任。
二、酌定不起诉情形
根据《刑事诉讼法》的相关规定，对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的，人民检察院可作出不起诉决定。例如：
- 因爱好收藏而非法持有枪支：但未用于违法活动，且主动坦白并上交枪支，有明显悔罪表现的，可考虑酌定不起诉。在非法制造枪支案中，若行为人存在类似情节，且犯罪情节轻微，也有可能获得酌定不起诉的处理。
三、证据不足不起诉
根据《刑事诉讼法》的相关规定，对于二次补充侦查后仍认为证据不足、不符合起诉条件的案件，人民检察院应作出不起诉决定。例如：
- 指控非法制造枪支但证据不足：若指控某人非法制造枪支，但证据不足或存在矛盾无法排除合理怀疑时，应作出证据不足不起诉的决定。
四、综合分析与建议
- 严格依法判断：检察机关在处理非法制造枪支案时，会严格依据法律规定和案件事实来判断是否免于起诉。因此，行为人应了解自己的行为是否构成犯罪，以及是否存在免于起诉的情形。
- 考虑案件特殊性：每个案件都有其独特性和复杂性，检察机关会综合考虑被告人的认罪态度、社会危害性等因素。因此，行为人应积极配合司法机关的调查和审理工作，如实供述罪行，真诚悔罪。
- 及时寻求法律帮助：若涉及非法制造枪支案，建议行为人及时向我咨询，以了解自己的权利和义务，并制定合适的应对策略。
最后需要强调的是，非法制造枪支是一种极其严重的犯罪行为，直接威胁社会的安全和稳定。因此，即使存在免于起诉的情形，也不应成为行为人触碰法律底线的理由。所有人都应该严格遵守法律法规，共同维护社会的安全和稳定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。