股东行使归入权的程序主要包括以下几个步骤：
确定归入权行使的依据：
- 股东行使归入权，通常基于公司董事、高级管理人员违反忠实义务，如自我交易、篡夺公司机会、违反竞业禁止等行为，这些行为导致公司利益受损，股东有权代表公司将因此获得的收益收归公司所有。
- 股东需首先确认存在上述违规行为，并收集相关证据，如交易合同、财务记录、会议纪要等，以证明董事或高级管理人员的违规行为及公司因此遭受的损失。
提出归入权请求：
- 股东在发现违规行为后，应向公司董事会或监事会提出书面请求，要求公司行使归入权，将违规所得收归公司。
- 若董事会或监事会拒绝行使归入权，或未在合理期限内作出回应，股东有权直接向法院提起诉讼，要求法院判决公司行使归入权。
法院审理与判决：
- 股东提起诉讼后，法院将审理案件，确认董事或高级管理人员的违规行为及公司因此遭受的损失。
- 若法院认定股东请求成立，将判决公司行使归入权，要求违规董事或高级管理人员将所得收益返还给公司。
执行与监督：
- 判决生效后，公司应负责执行归入权，将违规所得收归公司账户。
- 股东有权监督执行过程，确保公司正确行使归入权，维护公司利益。
在行使归入权过程中，股东需注意以下几点：
- 证据收集：股东应充分收集证据，证明董事或高级管理人员的违规行为及公司因此遭受的损失，这是行使归入权的基础。
- 程序合规：股东应按照法定程序提出归入权请求，先向公司董事会或监事会提出，若未得到回应或拒绝，再向法院提起诉讼。
- 诉讼时效：股东应注意诉讼时效，通常在知道或应当知道违规行为之日起一定期限内（如三年）提起诉讼，否则可能丧失胜诉权。
若股东未按照法定程序行使归入权，可能面临以下法律后果：
- 若股东未先向公司董事会或监事会提出请求，直接向法院提起诉讼，法院可能不予受理或驳回起诉。
- 若股东超过诉讼时效提起诉讼，法院可能判决驳回其诉讼请求，股东将无法通过法律途径维护公司利益。
在实际操作中，股东行使归入权可能遇到一些复杂情况，如违规行为涉及多个董事或高级管理人员、违规所得难以计算等。此时，股东应寻求专业法律帮助，确保正确行使归入权，维护公司利益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。