副总经理离职时，其持有的股份并不必然需要冻结，是否冻结取决于公司章程、股东协议或相关法律法规的具体规定，以及是否存在特定情形需要冻结。以下从不同角度进行分析：

1. 公司章程与股东协议的规定

• 公司章程：公司章程是公司的“宪法”，它规定了公司的基本运营规则和股东的权利义务。如果公司章程中明确规定了股东离职时股份需要冻结或转让的条款，那么副总经理离职时，其持有的股份可能需要按照章程规定进行处理。
• 股东协议：股东之间可能签订有股东协议，其中也可能包含关于股东离职时股份处理的条款。如果协议中有此类规定，同样需要遵守。

2. 法律法规的要求

• 公司法：根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，股东离职并不直接导致其股份被冻结。股份的转让、回购等需遵循公司法及公司章程的规定。
• 证券法：如果公司是上市公司，那么股份的处理还需遵守《中华人民共和国证券法》的相关规定，特别是关于信息披露和股份转让的限制。
• 其他法规：在某些特定行业或情况下，可能还有其他相关的法律法规对股份的处理提出要求。

3. 特定情形的考虑

• 竞业禁止：如果副总经理在离职后可能从事与公司竞争的业务，公司可能会通过股份冻结或回购等方式来限制其竞争行为。但这通常需要在股东协议或公司章程中有明确约定。
• 债务纠纷：如果副总经理在公司持有股份期间存在个人债务纠纷，且债权人要求冻结其财产（包括股份），那么股份可能会被司法冻结。但这与离职本身无直接关系，而是由债务纠纷引发。
• 公司稳定与利益保护：在某些情况下，为了维护公司的稳定和保护其他股东的利益，公司可能会考虑对离职股东的股份进行一定限制，如冻结或要求在一定期限内转让。但这同样需要依据公司章程或股东协议进行。

4. 实际操作建议

• 审查公司章程和股东协议：首先，应仔细审查公司章程和股东协议，了解其中关于股东离职时股份处理的规定。
• 协商与沟通：如果章程或协议中没有明确规定，或者规定不够明确，建议与副总经理进行协商，达成双方都能接受的股份处理方案。
• 法律咨询：在处理股份冻结或转让等复杂问题时，建议咨询专业律师，以确保操作合法合规。

总结来说，副总经理离职时其持有的股份是否需要冻结，并没有一个统一的答案。它取决于公司章程、股东协议的具体规定，以及是否存在需要冻结股份的特定情形。因此，在处理此类问题时，应综合考虑各种因素，并遵循相关法律法规和公司内部规定。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。