合同甲方为两家单位时，落款应分别由两家单位各自进行，并加盖各自的公章或合同专用章，同时由各自的法定代表人或其授权代表签字或盖章。具体分析如下：

一. 合同落款的基本要求

• 合同落款是合同签署的重要环节，它表明合同当事人对合同内容的确认和接受。
• 在落款处，通常需要加盖公章或合同专用章，并由法定代表人或其授权代表签字或盖章。

二. 甲方为两家单位时的落款方式

1. 各自落款：两家单位作为共同的甲方，应分别在合同的落款处进行签署。

    - 每家单位都应加盖自己的公章或合同专用章。
    - 每家单位的法定代表人或其授权代表都应在落款处签字或盖章。
   

2. 明确身份：在落款时，应注明每家单位的名称和身份，以确保合同的清晰性和准确性。

    - 例如，可以在落款处分别写明“甲方1（单位名称）”和“甲方2（单位名称）”。
   

三. 注意事项

• 确保两家单位都已知悉并同意合同的所有条款。
• 在签署前，建议两家单位之间进行充分的沟通和协商，以避免后续可能出现的纠纷。
• 如有必要，可以请专业的律师对合同进行审查，以确保合同的合法性和有效性。

我建议：在合同落款时，务必确保两家单位都按照上述要求进行签署，以保证合同的合法性和有效性。同时，也要注意保留好签署后的合同原件，以备不时之需。如有进一步需要，您可以继续咨询我。