申请政府项目是否可以用分公司，取决于具体的项目要求以及分公司的法律地位和实际运营情况。以下是对此问题的详细分析：

1. 项目要求：不同的政府项目对申请主体的要求可能不同。有些项目可能明确要求申请主体必须是具有独立法人资格的企业，而有些项目则可能对申请主体的组织形式没有特定要求。因此，在申请政府项目前，首先需要仔细阅读项目申报指南或相关文件，明确申请主体的资格要求。

2. 分公司的法律地位：分公司是总公司的附属机构，通常不具有独立的法人资格，其民事责任由总公司承担。因此，如果政府项目要求申请主体必须具有独立法人资格，那么分公司通常无法直接申请。然而，如果项目对申请主体的组织形式没有特定要求，或者允许以分支机构的名义申请，那么分公司可能有机会参与申请。

3. 分公司的实际运营情况：即使分公司符合项目对申请主体的形式要求，也需要考虑其实际运营情况。例如，分公司的经营范围、财务状况、技术实力等是否满足项目要求。如果分公司在这些方面与总公司存在显著差异，或者无法独立承担项目责任，那么可能会影响其申请政府项目的成功率。

综上所述，申请政府项目是否可以用分公司，需要根据具体的项目要求、分公司的法律地位以及实际运营情况来综合判断。建议在申请前仔细研究项目要求，并咨询相关部门或专业人士以获取更准确的指导。如果您在具体操作中遇到法律问题，可以直接向我咨询。