结论：因格式问题导致废标，一般情况下不会被罚款，但可能面临其他不利后果，具体需结合招标文件规定、法律法规要求及实际损失情况综合判断。以下从不同角度展开分析：

1. 招标文件是否明确约定罚款条款

• 若招标文件明确规定：因投标文件格式错误（如未密封、未签字盖章、未按要求装订等）导致废标的，招标人有权对投标人处以罚款或没收投标保证金，则需按合同约定执行。此类条款属于招标人设定的违约责任，具有合同效力。
• 若招标文件未约定：则招标人无权单方面对投标人罚款，但可依据《招标投标法》及相关规定，仅作废标处理。

2. 法律法规是否允许罚款

• 《招标投标法》及实施条例：未直接规定因格式问题废标需罚款，但赋予招标人拒绝不合格投标文件的权利（如第45条、第54条）。罚款需以合同约定或地方性法规为依据，若无明确依据，罚款行为可能被认定为违法。
• 《民法典》合同编：若格式问题构成违约（如未履行招标文件要求的义务），招标人可主张违约责任，但责任形式需为赔偿损失、支付违约金等，而非直接罚款。

3. 实际损失与因果关系

• 若招标人因废标产生实际损失（如重新招标费用、工期延误损失等），可要求投标人赔偿，但需证明损失与格式问题存在直接因果关系，且赔偿金额以实际损失为限。
• 若无实际损失：招标人仅能作废标处理，无权要求赔偿或罚款。

4. 行政处罚的可能性

• 投标人责任：格式问题通常属于投标文件瑕疵，不涉及行政违法，因此不会被行政机关罚款。
• 招标人责任：若招标人未依法组织招标（如未明确格式要求、违规废标），可能面临行政监督部门的处罚，但与投标人无关。

建议

1. 核查招标文件：重点查看“投标文件格式要求”“废标条款”“违约责任”等部分，确认是否存在罚款约定。
2. 保留证据：如招标文件、投标文件、废标通知等，以备后续争议。
3. 协商或申诉：若认为废标决定不合理，可与招标人协商，或向行政监督部门投诉（如发改委、住建部门）。
4. 法律救济：若因废标产生纠纷，可依据《民事诉讼法》提起诉讼或申请仲裁，主张权利。

总结：格式问题导致废标本身不直接引发罚款，但需警惕招标文件中的特殊约定。如有疑问，可直接向我咨询具体案件处理方案。