企业发现商业秘密被侵犯后，可采取的司法救济途径主要包括民事救济、行政救济和刑事救济三种。以下是对这三种途径的详细阐述：

1. 民事救济

• 提起诉讼：企业可以向有管辖权的人民法院提起民事诉讼，要求侵权人停止侵权行为，并赔偿因侵权所遭受的损失。根据《中华人民共和国反不正当竞争法》的相关规定，经营者违反本法规定，给他人造成损害的，应当依法承担民事责任。
• 证据保全与财产保全：在诉讼过程中，为防止侵权人销毁或转移关键证据，企业可以申请法院进行证据保全。同时，为确保在判决后能够顺利获得赔偿，企业也可以申请财产保全。
• 赔偿计算：赔偿数额通常按照权利人因被侵权所受到的实际损失确定；如果实际损失难以计算，可以按照侵权人因侵权所获得的利益确定。若权利人的损失或者侵权人获得的利益难以确定，可以参照该商业秘密许可使用费的倍数合理确定。对于恶意侵犯商业秘密且情节严重的，可以在上述方法确定数额的一倍以上五倍以下确定赔偿数额。赔偿数额还应当包括权利人为制止侵权行为所支付的合理开支。

2. 行政救济

• 向市场监督管理部门举报：企业可以向县级以上市场监督管理部门举报侵犯商业秘密的行为。市场监督管理部门在接到举报后，会依法进行调查处理。
• 行政处罚：如果查实存在侵犯商业秘密的行为，市场监督管理部门将责令侵权人停止违法行为，没收违法所得，并处以罚款。对于情节严重构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。

3. 刑事救济

• 报案与立案：如果企业的商业秘密被侵犯且情节严重，可能构成犯罪（如侵犯商业秘密罪）。此时，企业可以向公安机关报案。公安机关在接到报案后，会依法进行审查，并决定是否立案侦查。
• 刑事责任追究：一旦立案侦查，公安机关将依法收集证据，查明事实真相。如果查实存在犯罪行为，检察机关将提起公诉，由人民法院依法审判。侵权人将面临有期徒刑、拘役、罚金等刑事处罚。

额外建议：

• 在采取任何救济途径前，企业应确保已收集并保存了足够的证据来证明商业秘密的存在、侵权行为的发生以及两者之间的因果关系。
• 对于某些特殊行业，如军工、航天、芯片等，这些企事业单位拥有的机密往往不仅仅是商业秘密，还兼有国家秘密的属性。该类涉密信息被侵权或存在被侵权的风险时，企业应当第一时间向国家安全部门、保密部门及公安机关报告。

企业在发现商业秘密被侵犯后，应根据具体情况选择合适的司法救济途径，并积极采取措施保护自己的合法权益。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。