结论：交强险的2000元财产损失赔偿限额，原则上应赔付给第三者（受损方），而非垫付方。但具体处理需结合垫付性质、协议约定及保险理赔流程综合判断。以下是详细分析：

1. 交强险的赔偿对象与性质

• 根据《机动车交通事故责任强制保险条例》，交强险的赔偿对象是被保险机动车以外的第三者（即事故中的受损方），赔偿范围包括财产损失（限额2000元）和人身伤亡。
• 交强险的赔偿具有法定性和直接性，即保险公司应直接向第三者赔偿，除非存在特殊约定或法律程序（如代位求偿）。

2. 垫付行为的法律性质

• 您作为标的车方，向第三者垫付5000元的行为属于自愿补偿，而非法定义务。垫付后，您可能取得对第三者的债权（即要求第三者返还超出其应得赔偿的部分）。
• 但交强险的2000元赔偿是保险公司对第三者的法定赔偿，与您的垫付行为无直接关联。除非您与第三者、保险公司达成三方协议，明确将交强险赔偿直接支付给您，否则保险公司仍应赔付给第三者。

3. 实务操作中的处理方式

• 情况一：若您垫付时未与第三者约定交强险赔偿的归属，且第三者未放弃索赔权，则保险公司应将2000元赔付给第三者。您垫付的5000元中，超出交强险和商业险赔偿的部分（如3000元），可依据责任比例向第三者或己方保险公司（如投保车损险）主张返还。
• 情况二：若您与第三者签订书面协议，明确第三者同意将交强险赔偿权转让给您（即“债权转让”），且保险公司认可该协议，则保险公司可将2000元赔付给您。但此类协议需符合《民法典》关于债权转让的规定（如通知债务人）。
• 情况三：若第三者已从您处获得全额赔偿（5000元），并出具书面声明放弃对保险公司的索赔权，则保险公司可能将2000元赔付给您。但此类操作需谨慎，避免第三者事后反悔。

4. 建议与风险提示

• 保留证据：妥善保存垫付凭证（如转账记录、收条）、事故认定书、保险合同等材料，以备理赔或诉讼使用。
• 协商优先：尝试与第三者、保险公司协商，明确交强险赔偿的归属。若协商不成，可依据协议或法律规定主张权利。
• 法律程序：若第三者拒绝返还超额垫付部分，您可依据《民法典》合同编或侵权责任编，通过诉讼或仲裁途径解决。

总结：交强险的2000元原则上应赔付给第三者，但您的垫付行为可能通过协议或法律程序影响赔偿流向。建议根据具体情况选择协商、调解或诉讼方式维护权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询。