拿走店里三千元是否能立案，需结合具体情况判断，一般可能构成盗窃罪并达到立案标准。以下从不同角度进行分析：
一、是否构成犯罪及立案标准
若利用职务便利：
- 若行为人利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额达到三万元以上的，构成职务侵占罪，应立案追诉。但在此案例中，三千元并未达到职务侵占罪的立案标准。
若未利用职务便利：
- 若行为人未利用职务便利，而是秘密窃取店内财物，数额达到一千元至三千元以上的，构成盗窃罪，应立案追诉。在此案例中，三千元已经达到了盗窃罪中“数额较大”的标准，因此可以立案。
二、法律依据及量刑标准
- 盗窃罪：
- 根据《最高人民法院、最高人民检察院关于办理盗窃刑事案件适用法律若干问题的解释》，盗窃公私财物价值一千元至三千元以上、三万元至十万元以上、三十万元至五十万元以上的，应当分别认定为刑法第二百六十四条规定的“数额较大”“数额巨大”“数额特别巨大”。
- 达到当地规定的“数额较大”标准，或者多次盗窃、入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃的，处三年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处或者单处罚金。
三、实际操作建议
及时报警：
- 若发现店内财物被盗，应立即报警，由司法机关依法处理。
收集证据：
- 在报警前，应尽可能收集相关证据，如监控录像、目击者证言等，以便司法机关调查取证。
配合调查：
- 在司法机关调查过程中，应积极配合，提供真实、准确的证言和证据。
四、特殊情况说明
- 各地区标准可能不同：
- 虽然一般盗窃公私财物价值一千元至三千元以上属于数额较大，但各省、自治区、直辖市高级人民法院、人民检察院可根据本地区经济发展状况等，在规定数额幅度内确定本地区执行的具体数额标准。因此，在实际操作中，还需参考当地的具体规定。
总结来看，拿走店里三千元，在未利用职务便利的情况下，一般构成盗窃罪并达到立案标准。若遇到此类情况，建议及时报警并配合司法机关的调查工作。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。