股东出资后，是可以和持股公司签订项目投资协议的。不过，在具体操作时，我们需要从多个角度来细致分析这个问题，以确保协议的合法性和有效性。

一、法律角度

从法律层面来看，股东出资后成为公司的股东，享有股东权利，包括参与公司重大决策、选择管理者、监督公司运营等。同时，股东也有权与公司进行其他合法的商业交易，包括签订项目投资协议。但关键在于，这种交易必须遵循公司法、合同法等相关法律法规的规定，确保交易的公平、公正、公开，避免利益冲突和损害公司及其他股东的利益。

1. 协议内容合法性：项目投资协议的内容必须合法，不得违反法律法规的强制性规定。例如，协议中不能包含非法集资、欺诈等违法内容。

2. 程序合规性：签订项目投资协议时，应遵循公司章程和公司法的规定，履行必要的决策程序。例如，如果协议涉及公司重大投资或资产处置，可能需要经过股东会或董事会的决议。

3. 利益冲突避免：股东在签订项目投资协议时，应避免与公司存在利益冲突的情况。如果股东同时担任公司的高级管理人员或与公司有其他关联关系，应特别注意避免利用关联关系损害公司利益。

二、公司治理角度

从公司治理的角度来看，股东与公司签订项目投资协议可能会对公司治理结构产生影响。因此，在签订协议前，应充分考虑公司治理的稳定性和有效性。

1. 决策机制：如果项目投资协议涉及公司重大决策，应确保决策机制的有效运行。例如，通过股东会或董事会进行决议，确保所有股东都能参与决策过程。

2. 信息披露：股东与公司签订项目投资协议时，应确保信息的充分披露。这有助于其他股东了解协议内容，保护他们的知情权。

3. 利益平衡：在签订协议时，应平衡股东和公司之间的利益。避免因协议条款过于偏向一方而损害另一方的利益。

三、实际操作建议

1. 明确协议目的和条款：在签订项目投资协议前，应明确协议的目的和条款。包括投资金额、投资期限、收益分配、风险承担等关键内容。

2. 咨询专业意见：由于项目投资协议涉及复杂的法律和商业问题，建议股东在签订前咨询专业律师或财务顾问的意见。这有助于确保协议的合法性和有效性。

3. 履行决策程序：根据协议内容和公司章程的规定，履行必要的决策程序。例如，如果协议涉及公司重大投资，可能需要经过股东会或董事会的决议。

4. 关注后续执行：签订协议后，应关注协议的后续执行情况。确保双方按照协议约定履行义务，避免出现违约情况。

总结与建议：股东出资后是可以和持股公司签订项目投资协议的，但必须确保协议的合法性和有效性。在签订前，应充分考虑法律、公司治理和实际操作等多个角度的因素。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。