结论前置：在房租已付但合同未签的情况下，房东锁门店的行为一般不合法，且可能侵犯租户的合法权益。房东应通过合法途径解决争议，避免采取过激手段。
一、合同未签的法律状态
在房租已付但合同未签的情况下，双方之间并未形成正式的租赁合同关系。然而，根据《民法典》的相关规定，即使没有书面合同，如果双方已经实际履行了租赁行为（如租户支付了房租，房东接受了房租并允许租户使用房屋），则可能被视为存在事实上的租赁关系。但这种关系在法律上相对不稳定，容易引发纠纷。
二、房东锁门店的合法性分析
无合同约束下的行为限制：
- 在没有正式租赁合同的情况下，房东对房屋的控制权受到一定限制。房东不能随意锁闭门店，因为这可能侵犯租户对房屋的实际使用权。
租户权益的保护：
- 租户已经支付了房租，即使合同未签，也享有一定的房屋使用权。房东锁门店的行为可能构成对租户权益的侵犯，租户有权要求房东停止侵权行为并赔偿损失。
合法途径的解决：
- 如果房东认为租户存在违约行为（如未按时支付后续房租、损坏房屋等），应通过合法途径解决争议，如与租户协商、发送催款函、提起诉讼或申请仲裁等。锁门店等过激手段不仅可能无法有效解决问题，还可能引发更大的法律风险和经济损失。
三、法律建议与风险防范
尽快签订书面合同：
- 双方应尽快签订书面租赁合同，明确各自的权利和义务，以避免因合同不明确而引发的纠纷。
保留相关证据：
- 双方应保留与租赁行为相关的所有证据，如房租支付凭证、房屋使用情况记录等，以备在发生纠纷时作为证据使用。
避免过激手段：
- 房东应避免采取锁门店等过激手段来解决争议。如果租户存在违约行为，房东应通过合法途径来维护自己的权益。
寻求法律帮助：
- 如果双方无法自行解决争议，可以寻求专业律师的帮助。律师可以根据具体情况提供法律建议，并协助双方通过合法途径解决争议。
四、可能的法律后果
如果房东擅自锁门店，可能面临以下法律后果：
侵犯租户权益的赔偿：
- 租户有权要求房东停止侵权行为并赔偿因锁门店而造成的损失，如营业中断损失、物品损坏损失等。
行政处罚：
- 如果房东的行为违反了相关法律法规（如《中华人民共和国治安管理处罚法》中关于非法侵入他人住宅或非法限制他人人身自由的规定），可能面临行政处罚。
刑事责任：
- 在极端情况下，如果房东的行为构成犯罪（如非法拘禁罪），可能面临刑事责任。
总结：在房租已付但合同未签的情况下，房东锁门店的行为一般不合法，且可能侵犯租户的合法权益。房东应通过合法途径解决争议，避免采取过激手段。如果双方无法自行解决争议，可以寻求专业律师的帮助。作为租户，如果遇到类似情况，应及时保留证据并寻求法律帮助以维护自己的权益。