公司入职让签保密协议是合法的。以下从法律依据、合理性、注意事项三个角度为您详细分析：
法律依据
根据《中华人民共和国劳动合同法》第二十三条的规定，用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。这一条款明确赋予了用人单位与劳动者签订保密协议的权利，因此，公司入职时让员工签订保密协议是具有法律效力的。
合理性分析
- 保护商业秘密：企业在运营过程中会积累大量的商业秘密，如客户名单、技术配方、营销策略等。这些秘密是企业的核心竞争力所在，一旦泄露，可能会给企业带来巨大的经济损失。通过签订保密协议，可以约束员工的行为，防止商业秘密的泄露。
- 维护竞争优势：在激烈的市场竞争中，企业需要不断创新和保持自身的优势。保密协议有助于企业保护其创新成果和技术优势，确保其在市场中处于领先地位。
- 符合法律法规要求：如前所述，签订保密协议是企业合法合规经营的一种体现，也是保障企业和员工双方权益的重要措施。
注意事项
- 了解协议内容：员工在签订保密协议前，应仔细阅读协议条款，确保自己清楚理解各项权利和义务。如果对协议内容有疑问，应及时向用人单位咨询，以免因误解协议内容而引发不必要的纠纷。
- 评估自身能力：员工应考虑自己是否能够胜任涉及保密信息的工作，并有能力履行保密义务。如果认为自己无法承担保密责任，可以与用人单位沟通协商，寻求合理的解决方案。
- 关注合法权益：虽然保密协议是为了保护企业的利益，但也不能忽视员工的合法权益。例如，协议中的违约责任应合理合法，不应设置过于苛刻的条款。同时，员工也有权要求用人单位在协议中明确保密期限、保密范围等关键信息。
建议：在签订保密协议时，员工应保持谨慎态度，确保自己充分理解协议内容并有能力履行保密义务。如果对协议内容有任何疑问或担忧，可以及时向用人单位提出并寻求解决方案。同时，用人单位也应确保协议内容合法合规，并充分尊重员工的合法权益。
后续行动建议：如果您在签订保密协议过程中遇到任何问题或纠纷，可以直接向我咨询，我将为您提供专业的法律建议和帮助。