结论：在教师编制服务期内转为公务员，是否需要赔偿违约金，取决于劳动合同中的具体约定以及相关法律法规的规定。若劳动合同中明确规定了服务期及违约金条款，且该条款不违反法律法规的强制性规定，则可能需要赔偿违约金；若劳动合同中无相关约定或约定违法，则无需赔偿。
一、劳动合同中的约定
服务期条款：
- 若您与学校签订的劳动合同中明确规定了服务期（如三年），并且约定了在服务期内离职需支付违约金，那么根据合同的约定，您可能需要承担违约责任。
- 但需要注意的是，服务期条款必须合法合理，不能违反法律法规的强制性规定。例如，服务期过长或违约金过高，可能被视为不合理条款。
违约金条款：
- 违约金的具体数额和支付方式应在劳动合同中明确约定。若合同中有此条款，且您决定在服务期内离职，则需按照合同约定支付违约金。
- 然而，如果违约金条款违反了法律法规（如违约金过高，超出了实际损失的合理范围），则该条款可能被视为无效。
二、相关法律法规的规定
《中华人民共和国劳动合同法》：
- 根据该法，用人单位与劳动者可以约定服务期，但约定的服务期应当合理。同时，用人单位不得与劳动者约定由劳动者承担违约金的其他情形，除非是违反服务期约定或竞业限制约定的。
- 如果劳动合同中的违约金条款违反了该法的规定，那么该条款可能被视为无效，您无需承担违约责任。
人事档案转移：
- 劳动合同中通常不会规定教育局可以扣留人事档案作为违约的惩罚。如果合同中明确写了不能以任何理由扣留人事档案，那么教育局扣留档案的行为是不合规的。
- 您有权要求教育局按照合同约定和法律规定，及时转移您的人事档案。
三、实际操作建议
审查劳动合同：
- 仔细审查您与学校签订的劳动合同，特别是关于服务期和违约金的条款。确定这些条款是否合法合理，以及您是否需要承担违约责任。
与教育局协商：
- 如果您决定在服务期内离职并转为公务员，建议与教育局进行友好协商。说明您的情况和离职意愿，并尝试达成一个双方都能接受的解决方案。
寻求法律援助：
- 如果您与教育局在违约金问题上无法达成一致，或者认为教育局的行为违反了法律法规或合同约定，您可以寻求法律援助或咨询专业律师（如我），以维护您的合法权益。
总结：在教师编制服务期内转为公务员是否需要赔偿违约金，取决于劳动合同中的具体约定以及相关法律法规的规定。建议您仔细审查合同条款，并与教育局进行友好协商。如有需要，可以寻求法律援助以维护您的合法权益。如果您有任何法律问题或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。